基于R语言的聚类(谱聚类)

本文介绍了如何使用R语言进行谱聚类,并通过对比k-means聚类,展示了谱聚类在处理复杂形状数据集上的优势。示例中,k-means无法有效聚类,而谱聚类则能显著改善聚类结果。

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谱聚类
在上一讲当中,我们讲解了基于模型的聚类,也就是混合模型,实质上是首先拟合一个混合概率分布,再求条件概率,最终确定每一个点应当属于哪一类。在这一讲当中,我们谈一谈谱聚类,谱聚类和DBSCAN这种聚类方法一样,都是适用于那种奇形怪状的数据集,绝大多数都是人造数据集,比如下图:
奇形怪状的数据
像这种样子的数据,k-means或者一般基于距离的聚类算法都会无效。基于密度的聚类算法也不行,因为样本整体分布比较均匀,均匀的线条构成了各种图形,那么谱聚类就是适用这种情形。下面通过一个例子说明。

#清除变量空间
rm(list=ls())
#载入包
library("kernlab")
#载入画图包
library("ggplot2")
#引入数据
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