图结构选型：Gephi 、 OrientDB；maven日常用法； ssh X11Forward

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已于 2024-03-29 11:17:50 修改 · 594 阅读

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#Gephi #OrientDB #图数据库 #x11forward

于 2024-01-03 18:24:58 首次发布

本文探讨了图结构可视化工具如Gephi和Cytoscape，以及支持这些工具的开源免费图数据库如ArangoDB、OrientDB和JanusGraph。文中还提到了Neo4j和Dgraph的选择，并指出Neo4j的专业版收费。Pajek作为另一种选择，适合入门。此外，文章提供了安装和使用这些工具的示例，以及对不同数据库易用性和资源的评估。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

图结构选型

图可视化工具

图结构可视化、分析（开源、完全免费、重型PC软件）：Gephi 、 Cytoscape

还有另外三个等待确定： Graphexp 、 KeyLines 、 Linkurious

支持以上图可视化工具的图数据库

图数据库（开源、完全免费、支持可视化工具Gephi或Cytoscape）： ~~ArangoDB~~ 、OrientDB、JanusGraph、hugegraph
丢弃的：弃Neo4j，因此专业版收费；弃Amazon Neptune, 因无其源码
企业版收费但有免费版且不开源的：ArangoDB

一些参考：

图数据库排名

比较 Dgraph,Neo4j,OrientDB,Titan（JanusGraph）

TODO 再问: ArangoDB、OrientDB、JanusGraph 谁导入更方便、谁更容易使用、谁的教程资料更多、谁更容易上手？

JanusGraph ：存储有点复杂？不适合单机？

另类的

Pajek: 无源码、免费、只有微软windows平台、容易上手

txt2pajek

可视化库（非独立运行的工具）

理论上不喜欢可视化库，不方便

以下待确定：

graph_tool
networkx

Gephi

Gephi导入例子：ImportContainerImplTest.java

git clone https://github.com/gephi/gephi.git
cd gephi

javac -version #javac 11.0.21

maven日常用法

mvn走代理
alias mvnProxy7890='mvn -Dhttp.proxyHost=localhost -Dhttp.proxyPort=7890 -Dhttps.proxyHost=localhost -Dhttps.proxyPort=7890 '
比如 maven下载当前项目依赖的全部jar的源码但排除传递依赖: mvnProxy7890 dependency:sources -DexcludeTransitive=true
mvn清理掉没有正常下载到jar的（实际上下载的html）
alias mvnRMhtml='find ~/.m2/ -name _remote.repositories | xargs -I@ dirname @ | xargs -I% sh -c "file %/*.jar | grep HTML 1>/dev/null 2>/dev/null && rm -v %/* " '

比如清理掉mvn因为下载不到外网依赖而导致jar被下载为html文件、 mvn镜像需要用户名密码时却没提供

hugegraph

备注从 ip a可知： docker-proxy(即bridge网络)的ip地址为 172.17.0.1

hugegraph:server+hubble

hugegraph/hubble

文件 docker-compose.yml 内容如下，启动命令docker-compose up -d

version: '3'
services:
    server:
        image: hugegraph/hugegraph
        container_name: graph
        environment:
          - PRELOAD=true
        # set 18080:8080 to expose the port 18080 in your local machine
        ports:
          - 8080:8080

    hubble:
        image: hugegraph/hubble
        container_name: hubble
        ports