hdpai2018的博客

由于我之前已经在服务器里装好了gromacs和NAMD，因此openmpi fftw等都已经装好了。假装所有的依赖包都没有安装，那么在root权限下输入下面的命令：apt-get install gccapt-get install g++apt-get install mpi-default-*apt-get install libfftw3*即可把这些包都安装好。直接安装lammpstar -xvf lammps-stable.tar.gzcd lammps-3Mar20/src/MA

在优化表面，二维或一维体系时，必须固定某个或某几个晶胞方向不优化。VASP本身没有这个功能，但是提供了constr_cell_relax.F文件来设置。根据文件中的提示，添加几行代码后，就可以任意固定晶胞方向了。使用方法：在目录下建立文件OPTCELL，第一行输入三个数字（比如110），数字1表示优化，数字0表示不优化；三个数字依次对应于xyz方向。比如110表示z轴不优化；001表示x和y轴都不优化。注1. 无OPTCELL文件则完全是原版软件的功能；注2. 只适用与正交晶胞，所有角都是直