hdpai2018的博客

文章来源：“分子动力学”公众号链接：https://mp.weixin.qq.com/s/rpLeA1K5A7eTmeguzFHeAQvasp做分子动力学的好处，由于vasp是近些年开发的比较成熟的软件，在做电子scf速度方面有较好的优势。缺点：可选系综太少。尽管如此，对于大多数有关分子动力学的任务还是可以胜任的。主要使用的系综是 NVT 和 NVE。下面我将对主要参数进行介绍！一般做分子动力学的时候都需要较多原子，一般都超过100个。当原子数多的时候，k点实际就需要较少了。有的时候用一个k点就行，不

文章来源：“分子动力学”公众号链接：https://mp.weixin.qq.com/s/_bHljlb4IUt4rJE1q48W0wuname -a # 查看内核/操作系统/CPU信息的linux系统信息head -n l /etc/issue # 查看操作系统版本cat /proc/cpuinfo #查看CPU信息hostname # 查看计算机名的linux系统信息命令lspci -tv # 列出所有PCI设备lsusb -tv #列出所有USB设备的linux系统信息命令lsmod

文章来源：“分子动力学”公众号链接：https://mp.weixin.qq.com/s/iAqFt1OVzAgzHdxqF_TORw一、Linux那些事Linux诞生于上世纪90年代，它的诞生离不开两个重要支柱，就是Unix和和GNU Project为核心的自由软件运动。其中Unix与Linux内核有直接血缘关系。赫尔辛基大学学生Linus Torvalds在1991年8月,以1987年Andrew S.Tanenbaum发布的一个用于教学的类Unix系统Minix为蓝本开发了一套新的兼容8038

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一、案例学习在这里插入图片描述认真学习，加油！

MATLAB安装过程中你有没有出现这种问题？提示：“cannot find appropriate setup.exe file”怎么解决呢：1、首先，请确保你在安装matalab时，已经将matalab的镜像文件解压。如若不然，则定会出现cannot find appropriate setup.exe file的问题。2、解压缩后，如果你不知道你的操作系统是多少位的，可直接点击解压之后根目录文件夹下的setup.exe可执行文件。3、如果确定你的操作系统是64位的，可直接打开根目录下的bin文

该版本于2020年7月9日发布。这些发行说明记录了自先前的2020.2版本以来GROMACS中进行的更改，以解决已知问题。它还包含了2019.6版或更早版本中的所有修复程序

密度梯度限制理论–半导体器件仿真一、静电和电荷载流子守恒半导体器件的物理场仿真包括由电场（漂移）和载流子浓度梯度（扩散）驱动的载流子迁移。电场（V/m）由准静态假设下的静电方程式给出：式中， 是介电常数（F/m）， 是电荷密度（C/m3）， 是电势（V）。电荷密度 由空穴、电子、电离的施主和电离的受主浓度（1/m3）（分别为 , , 和 ）给出。式中， 是基本电荷（C）。电子和空穴浓度（ 和 ）受以下连续性方程给出的守恒定律约束：式中， 是时间（秒）； 和 是电子和空穴的电流密度（A

一、在设计工作流程中使用拓扑优化结果拓扑优化是一项有用的功能，它可以找到我们无法合理想到的设计。我们可以基于拓扑优化的结果提出新的设计，然后对其进行进一步的仿真分析。但是，我们该怎么做呢？我们可以用comsol进行二维和三维模拟、剖分网格的几何形状，或者用一个代表拓扑优化结果的导入网格。在 COMSOL 中，我们可以直接使用它们，也可以将其导出到各种 CAD 软件平台。下面，我们首先研究如何创建几何结构，然后再讨论如何跳过创建几何的步骤，直接通过导入和修改网格进行仿真。二、如何在COMSOL中生成拓扑

如何基于光学显微镜图像对材料结构进行仿真分析。一、材料的性能很大程度上取决于其结构。材料微观组织通常包含性质不同的 2 个相或多个相。材料生产的每个环节，都会在材料组织上以孔的形状和体积，夹杂物的取向和大小等形式留下痕迹。因此，定量结构表征对于评估材料的性能及其在实际应用中的性能至关重要。二、什么是合成石墨合成石墨是一种具有高热导电性和优越的化学惰性材料，在惰性气体和高温中具有稳定性，被广泛应用于高温和腐蚀性化学环境。在所有的合成石墨种类中，等静压细晶粒石墨的结构最精细和均质性（各向同性）最好，常用于

一、电磁损耗的热源有多种类型。我们可以使用 COMSOL软件的内置功能计算所有的电磁热源（准静态或高频状态）；软件中预定义的接口包括焦耳热，感应加热，微波加热 和激光加热。1、焦耳热多物理接口耦合了固体传热 与电流 接口（AC/DC 模块）。它考虑了由传导电流和介电损耗产生的热量。使用 焦耳热接口模拟电阻装置。2、感应加热多物理接口耦合了固体传热与磁场接口（AC/DC 模块）。它考虑了由感应电流和磁损耗产生的热量。3、微波加热多物理接口耦合了固体传热 与电磁波，频域 接口（RF模块）。它考虑了高

COMSOL软件及其大多数附加模块均有内置材料库，这些材料库包含材料及相关材料特性数据。自 5.5 版本开始，COMSOL 软件中还增加了一个附加产品-材料库，包含多达 24 种材料属性，可以模拟 3800 多种材料。所有这些属性均带有参考信息。几乎所有的材料属性都可以定义为温度T的函数，我们可以将传热仿真中的温度场仿真结果作为此函数的输入值。材料属性包括：导热系数、热膨胀系数、恒压热容、电导率、密度、杨氏模量、泊松比、屈服应力和硬化曲线、动态黏度；注意：特定材料的材料属性取决于材料的类型。材料库中

一、导数、微分1、比如某变量称为u，那么在COMSOL中ux就代表对u对x求导，即du/dx。2、当然COMSOL也提供了微分算子，比如d，使用d(u,x)可以达到与上述ux一样的效果。3、因为COMSOL自带的一个方程只是对某些变量求微分，当我们需要对自己想要求微分的变量进行操作时，使用d(函数，因变量)就可以实现了。4、还有一种是pd，使用pd(u,x)计算出的结果和上述ux就不一样了，这里pd虽然也是求导，但链式法则不再适用；举个例子：u+x, 其中u是x的函数。使用d(u+x, x),

一、几何单元的类型目前有四种不同的三维单元类型：四面体、六面体、棱柱，以及金字塔形：可以任意组合这四种单元来对任何三维模型进行网格剖分。二、不同几何单元适用范围1、四面体单元四面体单元是 COMSOL 中大部分物理场的缺省单元类型。四面体也称简化网格，简言之，它是指任何三维体都可以利用四面体进行网格剖分，而不论其形状或是拓扑如何。它们也是唯一一种可用于自适应网格细化的单元类型。因此，四面体通常是您的第一选择。2、六面体、棱柱和金字塔形仅用于确实需要时。首先应注意的是，这些单元并非总能剖分具体几

一、在 COMSOL 中提供了两种变形网格形式可供选择，分别是动网格 (ale) 和变形几何 (dg)；这两者的使用方法完全一样，只是适用场景略有不同：1）当我们希望明确定义材料在域中每点处的应变时，应使用移动网格接口。它特别适用于模拟固体域的形变可以完全确定的情况。体积的变化说明材料被拉伸或压缩，但总质量保持不变。2）当只需定义域边界处的形状时，可以使用变形几何接口。它最适合模拟流体域。域总体积的变化说明了模型质量的增加或减少。这里以动网格为例来进行介绍，首先我们需要在模型开发器中添加动网格物理场，依

1、必要的理论知识是必不可少的。面对一个课题或者项目，你必须明白其中涉及的物理场，以及描述这些物理场的数学方程，相关的约束（或者说边界条件），材料属性，根据理论知识是否能够推理哪些因素可能会影响模型的收敛性。有了上述基础，你才能正确使用软件，选择合适的建模步骤，包括物理场接口、材料属性、边界条件、网格、求解、后处理分析等。2、快速入门：参加培训软件是一个工具，要想学好软件，最好的方法就是多动手练习。新手小白在入门之初往往会遇到很多报错不知道如何解决；所以，最佳的入门方法当属参培训、培训的时候老师一般会

COMSOL仿真你遇到过哪些“莫名其妙”的报错？很多用户最头疼的莫过于在自己的建模过程中遇到各种各样的，“莫名其妙”的错误；那么如何快速找出并分析排除模型中的错误，以及如何快速实现收敛。本文结合实践经验，指出几点分析报错的要点供大家参考。一、 我们可以把报错信息分为2种： 1、报错信息中给出了具体出错信息 1.1 根据报错提示，若材料有问题，那就查看材料设置；例如：在模块中对应的材料位置，选择了“来自材料”选项，而没有给相应的域或边界设定材料。 1.2 若网格有

1、光子晶体2、表面等离激元3、超材料和超表面4、光力5、光波导6、天线7、二维材料8、拓扑光子学9、非厄米光子学