HPA 数据库实用指南:解决科研文章逻辑衔接难题的实操教程

引言

在分子机制研究、肿瘤预后分析或药物靶点验证中,如何通过可靠的公共数据库支撑实验结论、增强研究逻辑的连贯性?Human Protein Atlas(HPA)作为目前最全面的人类蛋白质组数据库之一,凭借其丰富的组织 / 细胞表达数据、临床关联信息,成为科研人员补充实验证据、完善研究故事的重要工具。本文将从基础功能到实战应用,详细讲解 HPA 数据库的核心用法,助力解决科研文章中 80% 的逻辑衔接问题。

一、HPA 数据库核心功能与模块解析

HPA 数据库(官网:The Human Protein Atlas)整合了海量人类蛋白质表达及临床关联数据,其核心价值在于为科研人员提供 “蛋白质在哪里表达、表达差异是否关联临床结局” 的直接证据。主要模块包括:

  • 组织图谱(Tissue Atlas):覆盖 46 种正常人体组织的蛋白质表达数据,提供高清免疫组化图像及定量分析结果,可直观查看目标蛋白在不同组织中的表达特异性。
  • 病理图谱(Pathology Atlas):包含 20 种常见癌症的蛋白质表达数据及对应的临床信息,支持表达水平与肿瘤分期、预后等指标的关联分析。
  • 单细胞图谱(Single Cell Atlas):解析蛋白质在细胞亚群中的表达异质性,助力单细胞水平的机制研究。
  • 专项图谱:包括脑图谱、血液图谱、代谢图谱等,满足不同研究方向的细分需求。

二、HPA 基础操作:三步获取蛋白质表达数据

无论是验证基因在特定组织中的表达特征,还是筛选潜在靶点的表达模式,HPA 的基础操作均可快速实现目标。具体步骤如下:

  1. 精准检索基因:在官网搜索框输入目标基因名(如 TP53、EGFR、RRM2 等),点击检
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