spark使用中的一些总结-进阶版

Spark SQL进阶 spark sql 深度介绍,spark_dataFrame与pandas_dataFrame互转,基于pandas的完成自定义UDF函数,UDAF函数 阅读详情

太久没写博客了,我,回来了。

忙完毕业,写点啥呢,写点实习中的东西吧,主要关于spark的使用相关,相当于之前spark-scala的进阶版?惯例,我主要是做个笔记自己看的,如有雷同,算我抄你的。

  • rdd与dataframe选哪个用
  • dataframe的几个操作
  • 一些环境参数的配置与submit的问题
  • 一些语法细节的坑

rdd与dataframe

先说重点:尽量使用dataframe
看下https://blog.youkuaiyun.com/weixin_36607803/article/details/53214482,谢谢作者。

  • rdd
    (1)遇到action算子触发作业,transformation算子是不会立即触发作业提交,具体细节百度/Google;

    (2)stage的划分,划分的依据是依赖算子是否是shuffle(如reduceByKey,Join等)的,每个stage又可以划分成若干task;这个可以这么看,没有shuffle之前都是map操作,不怎么涉及节点之间的通信;

    (3)分区(Partition),影响你的并发和计算效率,比如,1000个并发,200个Partition,另外800个并发就空闲着,所以合理的设置repartition和shuffle.partitions

  • dataframe
    (1)DataFrame是一种以RDD为基础的分布式数据集,类似于传统数据库中的二维表格,和sql像的很;

    (2)Spark SQL得以洞察更多的结构信息,从而对藏于DataFrame背后的数据源以及作用于DataFrame之上的变换进行了针对性的优化,最终达到大幅提升运行时效率的目标;RDD,由于无从得知所存数据元素的具体内部结构,Spark Core只能在stage层面进行简单、通用的流水线优化。

dataframe的几个操作

想起来几个算几个吧,有点忘了。。

  • 一行变多行
    explode[A, B](inputColumn: String, outputColumn: String)
    例子1:xxDF.explode( “c3” , “c3_” ){time: String => time.split( ” ” )},原始c3列为String类型;
    例子2:withColumn(“A_”, explode(col(“A”))).drop(“A”),原始A列为Array类型;

  • 多行变一行
    groupBy(col1: String, cols: String*)
    例子1:groupBy(“A”).agg(collect_list(“B”) as “B_list”).withColumn(“C”, func1(func2(col(“B_list”))));

  • 多列拼接为一列
    concat
    例子1: select(col(“A”), concat(col(“B”), lit(“\t”), col(“C”)) as “BC”)

  • 一列变多列
    withColumn也行

  • join操作
    大表放左边

  • 填补缺失项
    DF.na.fill(value = 1.0f, cols=Array(“A”))

  • 增加某一固定列
    withColumn(“flag”, lit(“666”))

  • 重命名某一列
    withColumnRenamed(“A”, “C”)

  • 转换列的数据类型
    例子1:val df2 = df1.withColumn(“id1”,col(“id”).cast(StringType)).drop(“id”)

  • 比较diff
    例子1:val diff = when(col(“id1”) === col(“id”),1).otherwise(0)
    val cross_df = df2.join(df2_,”id”,”left”).withColumn(“diff”, diff).filter(col(“diff”) === 0)

  • dataframe某列进行统计排序
    例子1:val df_count = df_label.select(“T”).groupBy(“T”).count
    val df_count_sort = df_count.orderBy(“count”)
    细节见//https://blog.youkuaiyun.com/dabokele/article/details/52802150

一些参数上的配置与submit的问题

常见的就不说了,说下其他的,主要是优化任务执行:

  • 预执行/推测任务
    推测任务是指对于一个Stage里面拖后腿的Task,会在其他节点的Executor上再次启动这个task,如果其中一个Task实例运行成功则将这个最先完成的Task的计算结果作为最终结果,同时会干掉其他Executor上运行的实例。spark推测式执行默认是关闭的,可通过spark.speculation属性来开启。

    换句话说:有的搬砖工实在搬这个task太累,那么启动其他并发来做这个,谁先做完就把其他的任务kill掉,很明显这样可以提高速度,但是需要额外的资源。需要观察任务执行的时间分布,如果存在明显拖后腿的现象,则可以使用

  • GC Time
    GC Time太长,影响任务的速度。集群硬件的配置此处不太懂,不乱说,从使用者的角度,GC Time过高解决的思路:
    (1)给每个task分配的内存的确很少,调大内存executor memory
    (2)机器负载太重,cpu占用过高,导致没有cpu资源进行gc,从而gc时间长。(可以加入sepculate机制)

其他submit参数优化见https://www.cnblogs.com/haoyy/p/6893943.html,谢谢作者。

一些语法细节的坑

  • 读取文件
    本地文件:sc.textFile(“file:///home/xx”);
    hafs文件:spark.read.parquet(“hdfs://xx”)
    注意本地的斜杠有3个;

  • trim函数
    删除指定字符串的首尾空白符,类似会把什么”\001”,”\002”、”\t”、”\n”等都去掉的,小心用;

  • split函数
    主要关于split不小心会丢掉后面的空字符串,有毒,细节见https://www.cnblogs.com/fulse/p/7855939.html;

  • 一点小操作
    如果需要简单的二次排序,将2个key组合为tuple作为key,然后sortBy;

参考
1.https://www.cnblogs.com/ITtangtang/p/7977312.html
2.https://blog.youkuaiyun.com/uuffo/article/details/78288921

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B. Palm", title = "Prediction as a candidate for learning deep hierarchical models of data", year = "2012",}```Contact: rasmusbergpalm at gmail dot comDirectories included in the toolbox-----------------------------------`NN/` - A library for Feedforward Backpropagation Neural Networks`CNN/` - A library for Convolutional Neural Networks`DBN/` - A library for Deep Belief Networks`SAE/` - A library for Stacked Auto-Encoders`CAE/` - A library for Convolutional Auto-Encoders`util/` - Utility functions used by the libraries`data/` - Data used by the examples`tests/` - unit tests to verify toolbox is workingFor references on each library check REFS.mdSetup-----1. Download.2. addpath(genpath('DeepLearnToolbox'));Example: Deep Belief Network---------------------```matlabfunction test_example_DBNload mnist_uint8;train_x = double(train_x) / 255;test_x = double(test_x) / 255;train_y = double(train_y);test_y = double(test_y);%% ex1 train a 100 hidden unit RBM and visualize its weightsrand('state',0)dbn.sizes = [100];opts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;opts.momentum = 0;opts.alpha = 1;dbn = dbnsetup(dbn, train_x, opts);dbn = dbntrain(dbn, train_x, opts);figure; visualize(dbn.rbm{1}.W'); % Visualize the RBM weights%% ex2 train a 100-100 hidden unit DBN and use its weights to initialize a NNrand('state',0)%train dbndbn.sizes = [100 100];opts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;opts.momentum = 0;opts.alpha = 1;dbn = dbnsetup(dbn, train_x, opts);dbn = dbntrain(dbn, train_x, opts);%unfold dbn to nnnn = dbnunfoldtonn(dbn, 10);nn.activation_function = 'sigm';%train nnopts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;nn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.10, 'Too big error');```Example: Stacked Auto-Encoders---------------------```matlabfunction test_example_SAEload mnist_uint8;train_x = double(train_x)/255;test_x = double(test_x)/255;train_y = double(train_y);test_y = double(test_y);%% ex1 train a 100 hidden unit SDAE and use it to initialize a FFNN% Setup and train a stacked denoising autoencoder (SDAE)rand('state',0)sae = saesetup([784 100]);sae.ae{1}.activation_function = 'sigm';sae.ae{1}.learningRate = 1;sae.ae{1}.inputZeroMaskedFraction = 0.5;opts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;sae = saetrain(sae, train_x, opts);visualize(sae.ae{1}.W{1}(:,2:end)')% Use the SDAE to initialize a FFNNnn = nnsetup([784 100 10]);nn.activation_function = 'sigm';nn.learningRate = 1;nn.W{1} = sae.ae{1}.W{1};% Train the FFNNopts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;nn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.16, 'Too big error');```Example: Convolutional Neural Nets---------------------```matlabfunction test_example_CNNload mnist_uint8;train_x = double(reshape(train_x',28,28,60000))/255;test_x = double(reshape(test_x',28,28,10000))/255;train_y = double(train_y');test_y = double(test_y');%% ex1 Train a 6c-2s-12c-2s Convolutional neural network %will run 1 epoch in about 200 second and get around 11% error. %With 100 epochs you'll get around 1.2% errorrand('state',0)cnn.layers = { struct('type', 'i') %input layer struct('type', 'c', 'outputmaps', 6, 'kernelsize', 5) %convolution layer struct('type', 's', 'scale', 2) %sub sampling layer struct('type', 'c', 'outputmaps', 12, 'kernelsize', 5) %convolution layer struct('type', 's', 'scale', 2) %subsampling layer};cnn = cnnsetup(cnn, train_x, train_y);opts.alpha = 1;opts.batchsize = 50;opts.numepochs = 1;cnn = cnntrain(cnn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = cnntest(cnn, test_x, test_y);%plot mean squared errorfigure; plot(cnn.rL);assert(er<0.12, 'Too big error');```Example: Neural Networks---------------------```matlabfunction test_example_NNload mnist_uint8;train_x = double(train_x) / 255;test_x = double(test_x) / 255;train_y = double(train_y);test_y = double(test_y);% normalize[train_x, mu, sigma] = zscore(train_x);test_x = normalize(test_x, mu, sigma);%% ex1 vanilla neural netrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);opts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samples[nn, L] = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.08, 'Too big error');%% ex2 neural net with L2 weight decayrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);nn.weightPenaltyL2 = 1e-4; % L2 weight decayopts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samplesnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex3 neural net with dropoutrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);nn.dropoutFraction = 0.5; % Dropout fraction opts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samplesnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex4 neural net with sigmoid activation functionrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);nn.activation_function = 'sigm'; % Sigmoid activation functionnn.learningRate = 1; % Sigm require a lower learning rateopts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samplesnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex5 plotting functionalityrand('state',0)nn = nnsetup([784 20 10]);opts.numepochs = 5; % Number of full sweeps through datann.output = 'softmax'; % use softmax outputopts.batchsize = 1000; % Take a mean gradient step over this many samplesopts.plot = 1; % enable plottingnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex6 neural net with sigmoid activation and plotting of validation and training error% split training data into training and validation datavx = train_x(1:10000,:);tx = train_x(10001:end,:);vy = train_y(1:10000,:);ty = train_y(10001:end,:);rand('state',0)nn = nnsetup([784 20 10]); nn.output = 'softmax'; % use softmax outputopts.numepochs = 5; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 1000; % Take a mean gradient step over this many samplesopts.plot = 1; % enable plottingnn = nntrain(nn, tx, ty, opts, vx, vy); % nntrain takes validation set as last two arguments (optionally)[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');```[![Bitdeli Badge](https://d2weczhvl823v0.cloudfront.net/rasmusbergpalm/deeplearntoolbox/trend.png)](https://bitdeli.com/free "Bitdeli Badge")

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