SISSO项目中输入文件读取错误的排查与解决

SISSO项目中输入文件读取错误的排查与解决

SISSO A data-driven method combining symbolic regression and compressed sensing for accurate & interpretable models. 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/si/SISSO

问题背景

在使用SISSO机器学习工具进行材料或化学性质预测时，用户可能会遇到输入文件无法正确读取的问题。具体表现为程序在运行过程中报错"end-of-file during read"，提示文件读取过程中意外终止。

错误现象

当用户使用SISSO运行自己的训练数据(train.dat)和验证数据(valid.dat)时，程序抛出错误信息：

end-of-file during read, unit -5, file Internal List-Directed Read

这表明程序在读取输入文件时遇到了意外终止，文件似乎没有完整读取就被退出了。

问题根源

经过分析，这类错误通常与SISSO.in配置文件中参数设置不当有关。特别是当nsf(number of starting features)参数的数值与实际特征数量不一致时，会导致文件读取异常。

解决方案

1. 检查配置文件：打开SISSO.in文件，找到nsf参数设置项
2. 核对特征数量：确保nsf值与输入数据中的实际特征数量完全一致
3. 重新运行：修改保存后重新运行SISSO程序

深入理解

nsf参数在SISSO算法中扮演着重要角色，它决定了算法初始考虑的特征数量。当这个数值与实际数据特征数不匹配时：

• 如果nsf设置过大：程序会尝试读取不存在的特征列，导致读取越界
• 如果nsf设置过小：程序会忽略部分有效特征，影响模型性能

预防措施

为避免类似问题再次发生，建议：

1. 在准备输入文件前，先统计特征数量
2. 使用脚本自动检查特征维度与配置参数的匹配性
3. 对于大型数据集，可以先在小样本上测试参数设置

总结

SISSO工具对输入文件和参数配置有严格要求，特别是特征数量相关的参数需要精确匹配。遇到文件读取错误时，应优先检查维度相关的参数设置。通过仔细核对配置文件与数据文件的一致性，可以有效避免此类问题的发生。

SISSO A data-driven method combining symbolic regression and compressed sensing for accurate & interpretable models. 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/si/SISSO