Ketcher项目中序列模式下磷酸基团的键盘输入支持

Ketcher项目中序列模式下磷酸基团的键盘输入支持

ketcher Web-based molecule sketcher 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ke/ketcher

在化学结构编辑软件Ketcher的最新版本中，开发团队实现了一项重要的功能改进——允许用户在序列模式(RNA或DNA)下通过键盘直接输入磷酸基团(P)。这一功能优化了生物分子序列的编辑体验，使得用户能够更高效地构建核酸链结构。

功能背景

在生物化学领域，核酸(DNA和RNA)是由核苷酸通过磷酸二酯键连接而成的长链分子。每个核苷酸单元包含三个部分：磷酸基团、五碳糖(核糖或脱氧核糖)和含氮碱基。传统上，在化学结构编辑软件中构建核酸链时，磷酸基团通常需要从库中选择或通过特定操作添加，这在一定程度上影响了编辑效率。

技术实现

Ketcher 3.2.0-rc.1版本中，开发团队扩展了序列模式下的键盘输入支持，将字母"P"和"p"识别为磷酸基团的输入符号。这一改进使得：

1. 用户可以直接通过键盘输入P来添加磷酸基团
2. 磷酸基团的添加方式与通过库卡片添加完全一致
3. 该功能适用于RNA和DNA两种序列类型

实现这一功能时，开发团队保持了系统的简洁性，没有引入新的复杂逻辑，而是扩展了现有的键盘输入处理机制。这种设计决策确保了功能的稳定性和一致性。

使用场景

这一改进特别适用于以下场景：

1. 快速构建核酸链的5'端和3'端修饰
2. 编辑含有非标准磷酸化位点的核酸序列
3. 教学演示中快速展示核酸结构
4. 研究工作中需要频繁修改核酸序列的情况

验证与测试

该功能已在Ketcher 3.2.0-rc.1版本中得到验证，测试环境包括：

• 操作系统：MacOS 15
• 浏览器：Chrome 133.0.6943.142 (Official Build)(arm64)
• Ketcher版本：3.2.0-rc.1 Build at 2025-03-04

测试结果表明，键盘输入的磷酸基团能够正确添加到核酸序列中，且与通过界面操作添加的磷酸基团在化学性质上完全一致。

总结

Ketcher的这一功能改进虽然看似简单，但却显著提升了核酸结构编辑的效率。它体现了软件开发中"小改进，大影响"的设计理念，通过优化用户交互细节来提升整体使用体验。对于经常需要处理核酸结构的研究人员和学生来说，这一改进将大大简化他们的工作流程。

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