深度超图库(DHG):深度学习在图神经网络与超图神经网络中的应用指南
安装指南
目前,DHG的稳定版本是0.9.4,您可以使用以下命令通过pip轻松安装:
pip install dhg
若想体验包含最新特性的夜间构建版(0.9.5),可采用以下命令:
pip install git+https://github.com/iMoonLab/DeepHypergraph.git
请注意,夜间版本可能包含未经全面测试的最前沿方法和数据集,发现任何问题时,请在GitHub Issues上报告。
项目使用说明
DHG是一个基于PyTorch构建的深度学习库,专为图神经网络(GNN)和超图神经网络(HGNN)设计,支持从简单图结构到复杂的高阶信息传递。
快速入门
可视化展示
DHG提供强大的图形和超图可视化工具。以下是如何绘制不同类型的图结构的示例代码:
import matplotlib.pyplot as plt
import dhg
# 绘制一个随机图
g = dhg.random.graph_Gnm(10, 12)
g.draw()
plt.show()
# 绘制一个随机超图
hg = dhg.random.hypergraph_Gnm(10, 8)
hg.draw()
plt.show()
在低阶结构上的学习
以图结构为例,使用GCN的拉普拉斯矩阵平滑顶点特征:
import torch
import dhg
g = dhg.random.graph_Gnm(5, 8)
X = torch.rand(5, 2)
X_smoothed = g.smoothing_with_GCN(X)
API使用文档
DHG提供了丰富的API来支持谱基础和空间基础的操作。例如,在图结构上传递消息:
X_transferred = g.v2v(X, aggr="mean") # 使用均值聚合进行消息传递
对于超图,可以这样处理顶点到超边的消息传递:
Y_intermediate = hg.v2e(X, aggr="mean") # 顶点到超边
X_updated = hg.e2v(Y_intermediate, aggr="mean") # 超边再到顶点
实现模型的例子
创建一个简单的GCN卷积层:
import torch.nn.functional as F
class GCNConv(torch.nn.Module):
def __init__(self, input_dim, output_dim):
super().__init__()
self.linear = torch.nn.Linear(input_dim, output_dim)
def forward(self, X, g: dhg.Graph):
X = self.linear(X)
X = g.smoothing_with_GCN(X)
return F.relu(X)
这个简化的例子展示了如何利用DHG的功能结合PyTorch定义一个图卷积层。
DHG不仅简化了复杂结构的学习过程,还通过其丰富的API和模块化设计,使得研究人员能够高效地实验新的图和超图算法,同时也支持自动调参以优化模型性能。
确保查阅完整的官方文档来获取更详尽的信息和更多的实例,以及了解如何利用其独特的功能,如自动机器学习模块(基于Optuna)来提升您的模型训练和评估流程。
创作声明:本文部分内容由AI辅助生成(AIGC),仅供参考