PySR项目实战:符号回归技术详解与示例解析
前言
符号回归(Symbolic Regression)是一种强大的机器学习技术,它能够从数据中自动发现数学表达式,而无需预先指定模型形式。PySR作为一款高效的符号回归工具,提供了丰富的功能和灵活的配置选项。本文将深入解析PySR的核心功能,并通过实际示例展示其应用场景。
环境准备
首先需要导入必要的Python库:
import numpy as np
from pysr import *
基础应用示例
1. 简单符号搜索
最基本的应用场景是从数据中发现数学关系式。以下示例展示了如何发现表达式2 cos(x3) + x0^2 - 2:
# 生成随机数据
X = 2 * np.random.randn(100, 5)
y = 2 * np.cos(X[:, 3]) + X[:, 0] ** 2 - 2
# 创建并训练模型
model = PySRRegressor(binary_operators=["+", "-", "*", "/"])
model.fit(X, y)
print(model)
这个例子展示了PySR的基本工作流程:生成数据、配置运算符、训练模型和输出结果。
2. 自定义运算符
PySR允许用户定义自己的运算符,这在处理特殊数学关系时非常有用:
X = 2 * np.random.randn(100, 5)
y = 1 / X[:, 0]
model = PySRRegressor(
binary_operators=["+", "*"],
unary_operators=["inv(x) = 1/x"], # 自定义倒数运算符
extra_sympy_mappings={"inv": lambda x: 1/x}, # 为SymPy定义映射
)
model.fit(X, y)
进阶功能
3. 多输出回归
PySR支持同时发现多个输出变量的表达式:
X = 2 * np.random.randn(100, 5)
y = 1 / X[:, [0, 1, 2]] # 三个输出变量
model = PySRRegressor(
binary_operators=["+", "*"],
unary_operators=["inv(x) = 1/x"],
)
model.fit(X, y)
4. 结果可视化
分析回归结果时,可视化是重要手段:
from matplotlib import pyplot as plt
# 绘制预测值与真实值的对比
plt.scatter(y[:, 0], model.predict(X)[:, 0])
plt.xlabel('真实值')
plt.ylabel('预测值')
plt.show()
还可以输出LaTeX格式的表达式用于学术论文:
model.latex()[0] # 第一个输出变量的LaTeX表达式
实用技巧
5. 特征选择
面对高维数据时,特征选择至关重要:
X = np.random.randn(300, 30) # 30个特征
y = X[:, 3]**2 - X[:, 19]**2 + 1.5 # 仅使用2个特征
model = PySRRegressor(
binary_operators=["+", "-", "*", "/"],
unary_operators=["exp"],
select_k_features=5, # 自动选择最重要的5个特征
)
model.fit(X, y)
6. 数据去噪
对于含噪声数据,PySR提供去噪选项:
X = np.random.randn(100, 5)
noise = np.random.randn(100) * 0.1
y = np.exp(X[:, 0]) + X[:, 1] + X[:, 2] + noise
model = PySRRegressor(
binary_operators=["+", "-", "*", "/"],
unary_operators=["exp"],
denoise=True, # 启用去噪
)
model.fit(X, y)
高级应用
7. 使用Julia扩展功能
PySR基于Julia后端,可以无缝集成Julia生态:
from pysr import jl
# 安装并使用Julia的Primes包
jl.seval("""
import Pkg
Pkg.add("Primes")
import Primes
""")
# 定义素数计算函数
jl.seval("""
function p(i::T) where T
if (0.5 < i < 1000)
return T(Primes.prime(round(Int, i)))
else
return T(NaN)
end
end
""")
# 创建数据集
primes = {i: jl.p(i*1.0) for i in range(1, 999)}
X = np.random.randint(0, 100, 100)[:, None]
y = [primes[3*X[i, 0] + 1] - 5 + np.random.randn()*0.001 for i in range(100)]
# 配置并训练模型
model = PySRRegressor(
binary_operators=["+", "-", "*", "/"],
unary_operators=["p"],
niterations=100
)
model.fit(X, y)
8. 复数运算
PySR支持复数运算:
X = np.random.randn(100, 1) + 1j * np.random.randn(100, 1)
y = (1 + 2j) * np.cos(X[:, 0] * (0.5 - 0.2j))
model = PySRRegressor(
binary_operators=["+", "-", "*"],
unary_operators=["cos"],
niterations=100,
)
model.fit(X, y)
9. 自定义目标函数
用户可以完全自定义优化目标:
objective = """
function my_custom_objective(tree, dataset::Dataset{T,L}, options) where {T,L}
# 自定义目标函数实现
# ...
return loss_value
"""
model = PySRRegressor(
loss_function=objective,
# 其他配置...
)
10. 量纲分析
对于物理问题,可以加入量纲约束:
model = PySRRegressor(
dimensional_constraint_penalty=10**5, # 量纲违规惩罚系数
# 其他配置...
)
model.fit(
X, y,
X_units=["kg", "m"], # 输入变量单位
y_units="m/s^2" # 输出变量单位
)
结构化表达式
PySR 1.0引入了强大的表达式规范功能:
模板表达式
from pysr import TemplateExpressionSpec
template = TemplateExpressionSpec(
expressions=["f", "g"],
variable_names=["x1", "x2", "x3"],
combine="sin(f(x1, x2)) + g(x3)", # 定义表达式结构
)
model = PySRRegressor(
expression_spec=template,
# 其他配置...
)
参数化表达式
对于分类数据,可以学习类别特定的参数:
template = TemplateExpressionSpec(
expressions=["f"],
variable_names=["x1", "x2", "category"],
parameters={"p1": 3, "p2": 3}, # 每个类别一个参数
combine="f(x1, x2, p1[category], p2[category])"
)
性能监控
使用TensorBoard监控训练过程:
from pysr import TensorBoardLoggerSpec
model = PySRRegressor(
logger=TensorBoardLoggerSpec(log_dir="logs"),
# 其他配置...
)
结语
PySR作为一款强大的符号回归工具,从简单的数学表达式发现到复杂的结构化模型学习,提供了全面的解决方案。通过本文的示例,读者可以掌握PySR的核心功能和应用技巧,为解决实际问题奠定基础。无论是科学研究还是工程应用,PySR都能帮助用户从数据中发现有价值的数学关系。
创作声明:本文部分内容由AI辅助生成(AIGC),仅供参考



