Tacoma 项目启动与配置教程

Tacoma 项目启动与配置教程

tacoma Temporal networks in Python. Provides fast tools to analyze temporal contact networks and simulate dynamic processes on them using Gillespie's SSA. 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ta/tacoma

1. 项目目录结构及介绍

Tacoma 是一个用于分析和模拟时间接触网络的Python包，其目录结构如下：

tacoma/
├── _tacoma             # C++核心代码目录
├── docs                # 项目文档目录
├── img                 # 项目图片资源目录
├── jupyter_notebooks   # Jupyter笔记本文档目录
├── logo                # 项目logo资源目录
├── sandbox             # 沙盒目录，用于测试和示例
├── tacoma              # Python包目录
│   ├── __init__.py
│   ├── ...
├── .gitattributes
├── .gitignore
├── LICENSE             # 开源协议文件
├── MANIFEST.in
├── Makefile            # 编译脚本
├── README.md           # 项目说明文件
├── setup.py            # Python包设置文件

• _tacoma: 包含项目的C++核心代码。
• docs: 存放项目的文档，通常包含API文档和使用教程。
• img: 存放项目相关的图片资源，如图表、示例图片等。
• jupyter_notebooks: 包含与项目相关的Jupyter笔记本，通常用于演示和教学。
• logo: 存放项目logo和相关图形标识。
• sandbox: 提供了一个安全的环境来测试和运行示例代码。
• tacoma: Python包的主目录，包含了包的模块和类。
• .gitattributes 和 .gitignore: 用于Git版本控制的配置文件。
• LICENSE: 项目使用的开源协议。
• Makefile: 编译C++代码的Makefile脚本。
• README.md: 包含项目的基本信息和说明。
• setup.py: 用于构建和安装Python包的脚本。

2. 项目的启动文件介绍

Tacoma 项目的启动主要是通过Python的 setup.py 文件来完成的。这个文件定义了如何打包和安装Python包。

from setuptools import setup, find_packages

setup(
    name="tacoma",
    version="0.9.0",
    author="Benjamin F. Maier",
    author_email="benjamin.maier@uni-duesseldorf.de",
    packages=find_packages(),
    scripts=['scripts/tacoma'],
    url="https://github.com/benmaier/tacoma",
    license="MIT",
    description="Temporal networks in Python.",
    long_description=open("README.md").read(),
    install_requires=[
        "numpy",
        "scipy",
        "matplotlib",
        "networkx",
        "python-louvain"
    ],
)

在这个文件中，setup 函数包含了项目的基本信息，find_packages 用于自动发现所有的Python包，install_requires 列出了项目运行所依赖的其他Python包。

3. 项目的配置文件介绍

Tacoma 项目的配置主要是通过Python包内部的模块和类来实现的。用户可以通过修改 tacoma 目录下的Python文件来配置和定制项目。

例如，使用项目提供的函数创建时间接触网络：

import tacoma as tc

# 创建一个空的时间接触网络
temporal_network = tc.edge_changes()

# 配置网络的初始边和变化
temporal_network.N = 10
temporal_network.edges_initial = [(0, 1), (2, 3), ...]
temporal_network.t0 = 0.0
temporal_network.t = [0.8, 2.4, ...]
temporal_network.tmax = 3.1
temporal_network.edges_in = [...]
temporal_network.edges_out = [...]

在这个配置示例中，用户可以设置网络的节点数量、初始边、时间点以及边的进出变化等。

请注意，上述目录结构和配置信息是基于项目提供的资料概述的，具体细节可能需要根据实际的项目代码和文档进行调整。

tacoma Temporal networks in Python. Provides fast tools to analyze temporal contact networks and simulate dynamic processes on them using Gillespie's SSA. 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ta/tacoma