AMDock 项目教程

AMDock 项目教程

AMDock 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/am/AMDock

1. 项目的目录结构及介绍

AMDock 项目的目录结构如下：

AMDock/
├── github/
│   └── workflows/
├── idea/
├── tutorials/
├── gitattributes
├── AMDock_Manual.pdf
├── Change_History.md
├── LICENSE.txt
├── MANIFEST.in
├── README.md
├── grid_amdock.py
├── setup.cfg
├── setup.py
└── versioneer.py

目录结构介绍

• github/workflows/: 包含 GitHub Actions 的工作流配置文件。
• idea/: 可能包含与 IntelliJ IDEA 相关的配置文件。
• tutorials/: 包含项目的教程文件。
• gitattributes: Git 属性配置文件。
• AMDock_Manual.pdf: AMDock 的用户手册。
• Change_History.md: 项目的更新历史记录。
• LICENSE.txt: 项目的许可证文件。
• MANIFEST.in: 用于打包项目的清单文件。
• README.md: 项目的介绍和使用说明。
• grid_amdock.py: AMDock 的 PyMOL 插件文件。
• setup.cfg: 项目的配置文件。
• setup.py: 项目的安装脚本。
• versioneer.py: 用于管理项目版本的脚本。

2. 项目的启动文件介绍

AMDock 的启动文件是 grid_amdock.py。这个文件是一个 PyMOL 插件，用于启动 AMDock 工具。

启动步骤

1. 下载 grid_amdock.py 文件。
2. 安装 PyMOL 插件:
   • 打开 PyMOL。
   • 进入 Plugins > Manager Plugins > Install New Plugin。
   • 选择 grid_amdock.py 文件进行安装。
3. 重启 PyMOL。
4. 启动 AMDock:
   • 在终端中输入 AMDock 命令启动 AMDock。

3. 项目的配置文件介绍

AMDock 的配置文件主要包括 setup.cfg 和 setup.py。

setup.cfg

setup.cfg 是一个配置文件，用于定义项目的元数据和安装选项。它通常包含以下内容：

• metadata: 项目的基本信息，如名称、版本、作者等。
• options: 安装选项，如依赖包、脚本等。

setup.py

setup.py 是一个 Python 脚本，用于安装和管理项目。它通常包含以下内容：

• setup() 函数: 用于定义项目的元数据和安装选项。
• 依赖包: 列出项目所需的依赖包。
• 安装脚本: 定义项目的安装过程。

通过这些配置文件，用户可以自定义项目的安装和运行环境。

AMDock 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/am/AMDock