ZEISS Microscopy OAD 项目使用教程

ZEISS Microscopy OAD 项目使用教程

1. 项目目录结构及介绍

OAD/
├── Apeer/
├── BioApps/
├── Experiment_Feedback/
├── Guided_Acquisition/
├── Images/
├── Interfaces/
├── Machine_Learning/
├── Scripts/
├── SmartMicroscopy/
│   └── Detecting Mitosis/
├── Testdata/
├── Tutorials/
├── Videos/
├── ZEN_Connect/
├── jupyter_notebooks/
├── napari_python_czi/
├── .gitignore
├── LICENSE
├── README.md
└── ZEN_Open_Application_Development_OAD_GitHub.pdf

目录结构介绍

• Apeer/: 包含与Apeer相关的工具和脚本。
• BioApps/: 包含与生物应用程序相关的工具和脚本。
• Experiment_Feedback/: 包含实验反馈相关的工具和脚本。
• Guided_Acquisition/: 包含引导采集相关的工具和脚本。
• Images/: 包含项目使用的图像文件。
• Interfaces/: 包含与ZEN接口相关的工具和脚本。
• Machine_Learning/: 包含机器学习相关的工具和脚本。
• Scripts/: 包含通用的脚本文件。
• SmartMicroscopy/: 包含智能显微镜相关的工具和脚本，如Detecting Mitosis/。
• Testdata/: 包含测试数据。
• Tutorials/: 包含教程文件。
• Videos/: 包含视频文件。
• ZEN_Connect/: 包含与ZEN连接相关的工具和脚本。
• jupyter_notebooks/: 包含Jupyter Notebook文件。
• napari_python_czi/: 包含与napari和CZI文件处理相关的工具和脚本。
• .gitignore: Git忽略文件。
• LICENSE: 项目许可证文件。
• README.md: 项目介绍文件。
• ZEN_Open_Application_Development_OAD_GitHub.pdf: 项目详细介绍文档。

2. 项目启动文件介绍

项目中没有明确的“启动文件”，但可以通过以下方式启动项目：

1. Jupyter Notebook: 在jupyter_notebooks/目录下，你可以找到多个Jupyter Notebook文件，这些文件可以用于启动和运行项目中的示例代码。
2. Python脚本: 在Scripts/目录下，你可以找到多个Python脚本文件，这些脚本可以直接在命令行中运行。

3. 项目配置文件介绍

项目中没有明确的“配置文件”，但可以通过以下方式进行配置：

1. 环境变量: 可以通过设置环境变量来配置项目的行为。
2. 脚本参数: 在运行Python脚本时，可以通过命令行参数来配置脚本的行为。

例如，运行某个Python脚本时，可以使用以下命令：

python Scripts/example_script.py --param1 value1 --param2 value2

通过这种方式，可以灵活地配置和运行项目中的各个脚本。