开源项目 `dedup` 使用教程

开源项目 dedup 使用教程

1. 项目的目录结构及介绍

dedup/
├── cmd/
│   └── dedup/
│       └── main.go
├── internal/
│   ├── dedup/
│   │   ├── dedup.go
│   │   └── dedup_test.go
│   └── utils/
│       ├── utils.go
│       └── utils_test.go
├── go.mod
├── go.sum
└── README.md

• cmd/: 包含项目的入口文件。
  • dedup/: 具体的命令行工具入口。
    • main.go: 主程序入口文件。
• internal/: 包含项目的内部实现。
  • dedup/: 去重逻辑的实现。
    • dedup.go: 去重逻辑的主要代码。
    • dedup_test.go: 去重逻辑的测试代码。
  • utils/: 工具函数。
    • utils.go: 工具函数的主要代码。
    • utils_test.go: 工具函数的测试代码。
• go.mod: Go 模块文件，定义了项目的依赖。
• go.sum: Go 模块的校验和文件。
• README.md: 项目说明文档。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动文件位于 cmd/dedup/main.go。该文件是整个项目的入口点，负责初始化配置、解析命令行参数并调用内部的去重逻辑。

package main

import (
    "fmt"
    "os"
    "github.com/klauspost/dedup/internal/dedup"
)

func main() {
    // 解析命令行参数
    // 初始化配置
    // 调用去重逻辑
    dedup.Run()
}

3. 项目的配置文件介绍

项目本身没有显式的配置文件，但可以通过命令行参数进行配置。例如：

dedup -input input.bam -output output.bam

• -input: 指定输入文件路径。
• -output: 指定输出文件路径。

具体的命令行参数可以通过运行 dedup -h 查看帮助信息。

dedup -h

这将显示所有可用的命令行参数及其说明。

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以上是 dedup 开源项目的使用教程，涵盖了项目的目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望对您有所帮助！