Indigo ELN v2.0 开源化学电子实验室笔记本使用指南
项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/in/Indigo-ELN-v.-2.0 Indigo ELN v2.0 是一款专为化学和生命科学领域设计的开源电子实验室笔记本，为研究人员提供了完整的实验数据管理和工作流程优化解决方案。
项目概述
Indigo ELN v2.0 基于现代化技术栈构建，采用多层Web架构，支持现代开发标准。该平台能够帮助研究人员高效创建、存储、检索和共享化学信息，满足各种法律、监管、技术和科学要求。
核心功能特性
智能化实验管理
提供完整的实验生命周期管理，从实验设计到结果分析，全程数字化记录。支持多种实验模板，适应不同研究需求。
高级化学结构搜索
内置强大的分子结构搜索功能，支持按分子结构、反应方案和实验属性进行精确检索，大大提升数据查找效率。
完整生态系统集成
与多个开源化学工具深度集成：
- BingoDB：分子结构搜索服务
- Ketcher：化学结构编辑器
- Indigo Toolkit：化学信息学引擎
快速部署指南
环境准备
在开始部署前，请确保系统满足以下要求：
- 已安装最新版本的Docker
- 准备至少2GB可用内存
- 检查网络连接稳定性
本地安装步骤
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获取项目代码
git clone https://gitcode.com/gh_mirrors/in/Indigo-ELN-v.-2.0 cd Indigo-ELN-v.-2.0 -
创建数据持久化目录
sudo mkdir -p /var/local/indigoeln/{mongo-db,postgres-signature,postgres-crs,bingodb} -
配置CORS设置（可选） 如果需要从非localhost主机名访问应用，请更新docker-compose-local.yml文件中的CORS_ORIGIN环境变量。
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启动应用服务
docker compose -f docker-compose-local.yml up -
访问应用界面 启动完成后，在浏览器中访问
http://localhost:9000即可使用Indigo ELN。
服务架构说明
Indigo ELN v2.0 采用微服务架构，包含以下核心服务：
- mongo-db：MongoDB数据库服务，端口27017
- postgres-signature：签名数据库服务，端口5432
- postgres-crs：CRS数据库服务，端口15432
- bingodb：分子搜索服务，端口9999
- server：主应用服务，端口8080
- signature：签名服务，端口28080
- crs：CRS服务，端口38080
- indigoeln-ui：用户界面服务，端口9000
使用技巧与最佳实践
实验模板标准化
创建标准化的实验模板，确保实验记录的一致性和可重复性。建议根据研究领域定制专属模板。
数据安全管理
定期备份实验数据，设置合理的用户权限，保护敏感研究成果。
团队协作配置
提供完善的权限管理和共享功能，支持多人同时使用，适合研究团队协作。
常见问题解答
Q：如何迁移现有实验数据？ A：系统支持多种数据格式导入，具体操作请参考官方文档。
Q：默认登录凭证是什么？ A：默认管理员账户为admin/admin，建议在生产环境中修改默认密码。
Q：如何配置远程访问？ A：在docker-compose-local.yml中更新CORS_ORIGIN环境变量，指定远程机器的IP地址或主机名。
技术架构优势
Indigo ELN v2.0 的技术架构具有以下优势：
- 模块化设计：各服务独立部署，便于维护和扩展
- 容器化部署：使用Docker容器技术，确保环境一致性
- 开源免费：基于GNU General Public License v3发布，完全免费使用
- 灵活集成：可以轻松集成外部服务和数据库，无需更改核心代码
通过本指南，您将能够快速掌握Indigo ELN v2.0的核心功能，有效提升化学研究工作的效率和数据管理水平。
创作声明：本文部分内容由AI辅助生成（AIGC），仅供参考
