TaxonKit：高效实用的NCBI分类学工具包
项目基础介绍和主要编程语言
TaxonKit 是一个高效实用的 NCBI 分类学工具包，主要用于处理和分析生物分类数据。该项目由 Shen Wei 开发，主要使用 Go 语言编写。Go 语言的高效性和并发支持使得 TaxonKit 在处理大规模分类数据时表现出色。
项目核心功能
TaxonKit 提供了多种核心功能，包括：
- 分类树查询：列出给定 TaxID 下的所有子分类树。
- 分类线查询：查询给定 TaxID 的分类线。
- 分类线格式化：将分类线格式化为标准格式。
- 名称到 TaxID 转换：将分类名称转换为对应的 TaxID。
- TaxID 过滤：根据分类等级范围过滤 TaxID。
- 最低共同祖先计算：计算给定 TaxID 的最低共同祖先。
- TaxID 变更日志：从数据包中创建 TaxID 变更日志。
- 自定义分类数据包创建：支持创建自定义分类数据包，如 GTDB 和 ICTV。
项目最近更新的功能
TaxonKit 最近更新的功能包括：
- CAMI 格式转换：将元基因组数据转换为 CAMI 格式。
- CAMI 过滤：在 CAMI 元基因组数据中移除给定 TaxID 及其后代。
- 自定义分类数据包创建：支持创建 GTDB 和 ICTV 的自定义分类数据包。
这些更新进一步增强了 TaxonKit 的功能性和实用性，使其在处理复杂分类数据时更加高效和灵活。
创作声明：本文部分内容由AI辅助生成（AIGC），仅供参考
