MCMC 项目教程

MCMC 项目教程

mcmc A C++ library of Markov Chain Monte Carlo (MCMC) methods 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/mc/mcmc

1. 项目目录结构及介绍

MCMC 项目的目录结构如下：

mcmc/
├── docs/
├── examples/
├── include/
├── src/
├── .gitignore
├── .gitmodules
├── readthedocs.requirements.txt
├── readthedocs.yml
├── travis.yml
├── LICENSE
├── Makefile
├── NOTICE.txt
├── README.md
└── configure

目录介绍

• docs/: 包含项目的文档文件，通常用于生成项目的文档网站。
• examples/: 包含项目的示例代码，帮助用户理解如何使用 MCMC 库。
• include/: 包含项目的头文件，通常是库的核心代码。
• src/: 包含项目的源代码文件，通常是库的实现部分。
• .gitignore: 指定 Git 版本控制系统忽略的文件和目录。
• .gitmodules: 用于管理 Git 子模块的配置文件。
• readthedocs.requirements.txt: 用于配置 ReadTheDocs 文档生成工具的依赖项。
• readthedocs.yml: 用于配置 ReadTheDocs 文档生成工具的配置文件。
• travis.yml: 用于配置 Travis CI 持续集成工具的配置文件。
• LICENSE: 项目的许可证文件，通常是 Apache-2.0 许可证。
• Makefile: 用于编译和安装项目的 Makefile 文件。
• NOTICE.txt: 项目的通知文件，通常包含版权和归属信息。
• README.md: 项目的自述文件，通常包含项目的简介、安装和使用说明。
• configure: 用于配置项目的脚本文件，通常用于生成 Makefile 或其他构建文件。

2. 项目启动文件介绍

MCMC 项目的启动文件是 configure 脚本。该脚本用于配置项目的编译和安装选项。用户可以通过运行 ./configure 脚本来生成 Makefile 文件，然后使用 make 命令进行编译和安装。

使用方法

# 克隆项目到当前目录
git clone https://github.com/kthohr/mcmc.git

# 进入项目目录
cd mcmc

# 更新子模块
git submodule update --init

# 运行配置脚本
./configure

# 编译和安装
make
make install

配置选项

• -h: 打印帮助信息。
• -i: 指定安装路径，默认是当前目录。
• -f: 指定浮点精度模式，默认是 double。
• -l: 指定线性代数库，选择 arma 或 eigen。
• -m: 指定 BLAS 和 Lapack 库的链接选项。
• -o: 指定编译器优化选项，默认是 -O3 -march=native -ffp-contract=fast -flto -DARMA_NO_DEBUG。
• -p: 启用 OpenMP 并行化功能（推荐）。
• --header-only-version: 生成头文件版本，无需编译共享库。

3. 项目配置文件介绍

MCMC 项目的主要配置文件是 configure 脚本和 Makefile。configure 脚本用于生成 Makefile 文件，而 Makefile 文件则用于编译和安装项目。

configure 脚本

configure 脚本是一个 Bash 脚本，用于配置项目的编译和安装选项。用户可以通过运行 ./configure 脚本来生成 Makefile 文件，然后使用 make 命令进行编译和安装。

Makefile

Makefile 文件是由 configure 脚本生成的，用于编译和安装项目。用户可以通过运行 make 命令来编译项目，并通过 make install 命令来安装项目。

示例

# 运行配置脚本
./configure -i "/usr/local" -l eigen -p

# 编译项目
make

# 安装项目
make install

以上命令将使用 Eigen 线性代数库，启用 OpenMP 并行化功能，并将项目安装到 /usr/local 目录。

mcmc A C++ library of Markov Chain Monte Carlo (MCMC) methods 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/mc/mcmc