PySINDy 项目使用说明

PySINDy 项目使用说明

pysindy A package for the sparse identification of nonlinear dynamical systems from data 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/py/pysindy

1. 目录结构及介绍

PySINDy 项目是一个用于稀疏识别非线性动力系统的开源库，其目录结构如下：

• .github/: 存放与 GitHub 相关的配置文件，如工作流定义等。
• docs/: 包含项目的文档，包括示例、API 文档等。
• examples/: 存放使用 PySINDy 的示例代码，通常为 Jupyter 笔记本格式。
• pysindy/: 包含 PySINDy 的主要代码，包括模块、类和函数。
• test/: 存放单元测试代码，用于确保代码质量。
• .flake8、.gitattributes、.gitignore、.pre-commit-config.yaml、LICENSE、MANIFEST.in、README.rst、pyproject.toml: 项目维护文件，包括代码风格、忽略文件、许可证信息等。

每个目录下的具体文件和其作用，在后续的文档中会有详细说明。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动通常指的是安装和初始化过程。在 PySINDy 中，可以通过以下步骤进行：

首先，从 PyPI 安装 PySINDy：

pip install pysindy

或者，如果你需要从源代码安装，可以克隆仓库并执行以下命令：

git clone https://github.com/dynamicslab/pysindy.git
cd pysindy
pip install .

安装完成后，可以通过以下 Python 代码来启动 PySINDy 的基本功能：

import pysindy

# 创建一个SINDy模型实例
model = pysindy.SINDy()

# 使用模型进行一些基本操作，例如添加特征库、拟合数据等
model.add_featureLibrary("polynomial",{"degree": 2})

3. 项目的配置文件介绍

PySINDy 的配置文件主要用于定义项目的行为，如安装依赖、执行测试、构建文档等。以下是一些主要的配置文件及其作用：

• pyproject.toml: 这是一个用来描述 Python 包的配置文件，其中包括了项目的元数据和依赖信息。
• .pre-commit-config.yaml: 这个文件定义了 pre-commit 钩子，它可以在提交代码之前自动运行一些任务，比如代码格式化、静态分析等。
• setup.py 或 setup.cfg: 如果你使用的是 setuptools，这些文件会用来定义包的安装过程。

例如，以下是一个简化的 pyproject.toml 文件内容，它定义了 PySINDy 的依赖：

[build-system]
requires = ["setuptools", "wheel"]

[tool.setuptools]
packages = find:
install_requires = [
    "numpy",
    "scipy",
    "cvxpy",
    # 其他依赖
]

这个文件告诉 setuptools 如何构建和打包 PySINDy，同时指定了项目依赖的外部库。这些配置文件应该在项目初始化时创建，并在需要时更新。

pysindy A package for the sparse identification of nonlinear dynamical systems from data 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/py/pysindy