PRSice开源项目安装与使用教程

PRSice开源项目安装与使用教程

PRSice A software package for calculating, applying, evaluating and plotting the results of polygenic risk scores 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/pr/PRSice

1. 项目的目录结构及介绍

PRSice是一个用于计算、应用、评估和绘制多基因风险分数（PRS）的软件包。它的目录结构如下：

• .github/: 存放GitHub特定的配置文件。
• docs/: 包含项目的文档文件。
• helpers/: 存放一些辅助脚本或文件。
• inc/: 包含项目所需的头文件。
• lib/: 存放库文件。
• src/: 源代码目录，包括所有的C++和R源文件。
• test/: 测试代码和文件。
• CMakeLists.txt: CMake构建系统文件。
• CNAME: 域名配置文件。
• LICENSE: 项目使用的GPL-3.0协议许可证文件。
• Make_file.linux: Linux系统的Makefile文件。
• Makefile: 默认Makefile文件。
• Makefile.win: Windows系统的Makefile文件。
• PRSice.R: 主R脚本文件。
• README.md: 项目说明文件。
• mkdocs.yml: MkDocs文档配置文件。

2. 项目的启动文件介绍

PRSice.R是项目的主要启动文件，它是用R语言编写的。此脚本包含了运行PRSice所需的全部逻辑，用户可以通过命令行调用这个脚本，并传入必要的参数来进行PRS的计算、应用、评估和绘图。

3. 项目的配置文件介绍

配置文件主要用于定义项目的编译选项、依赖库和编译规则。PRSice项目的配置主要通过以下文件进行：

• CMakeLists.txt: 这是CMake的配置文件，用于定义编译过程和依赖。用户可以通过编辑这个文件来指定编译选项，例如指定C++的版本或者开启调试模式。

• Makefile: 这是Makefile构建系统的配置文件，它定义了构建项目所需的命令和规则。对于不同的操作系统（如Linux和Windows），提供了不同的Makefile文件。

用户在进行项目配置时，需要根据自己的操作系统选择合适的Makefile或者通过CMake进行配置。在修改这些配置文件后，用户可以运行相应的构建命令来编译源代码，生成可执行文件。

PRSice A software package for calculating, applying, evaluating and plotting the results of polygenic risk scores 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/pr/PRSice