celda 项目教程

celda 项目教程

celda Bayesian Hierarchical Modeling for Clustering Single Cell Genomic Data 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ce/celda

1. 项目的目录结构及介绍

celda 项目的目录结构如下：

celda/
├── data/
├── docs/
├── inst/
│   └── rmarkdown/
├── man/
├── src/
├── tests/
├── vignettes/
├── Rbuildignore
├── gitignore
├── CONDUCT.md
├── DESCRIPTION
├── LICENSE
├── NAMESPACE
├── NEWS.md
├── NOTICE
├── README.md
└── _pkgdown.yml

目录结构介绍：

• data/: 存放项目的数据文件。
• docs/: 存放项目的文档文件。
• inst/rmarkdown/: 存放 RMarkdown 文件。
• man/: 存放项目的帮助文档。
• src/: 存放项目的源代码文件。
• tests/: 存放项目的测试文件。
• vignettes/: 存放项目的 vignettes 文件。
• Rbuildignore: 用于指定在构建包时忽略的文件。
• gitignore: 用于指定在 Git 版本控制中忽略的文件。
• CONDUCT.md: 项目的行为准则文件。
• DESCRIPTION: 项目的描述文件，包含包的元数据。
• LICENSE: 项目的许可证文件。
• NAMESPACE: 项目的命名空间文件。
• NEWS.md: 项目的新闻和更新日志文件。
• NOTICE: 项目的通知文件。
• README.md: 项目的自述文件，包含项目的基本信息和使用说明。
• _pkgdown.yml: 用于配置 pkgdown 网站的文件。

2. 项目的启动文件介绍

celda 项目的启动文件主要是 DESCRIPTION 文件和 NAMESPACE 文件。

DESCRIPTION 文件

DESCRIPTION 文件包含了项目的元数据，如包的名称、版本、作者、依赖关系等。它是 R 包管理器在安装和加载包时的重要参考文件。

NAMESPACE 文件

NAMESPACE 文件定义了包的命名空间，指定了哪些函数和对象是导出的，哪些是内部的。它确保了包的函数在加载时不会与其他包的函数发生冲突。

3. 项目的配置文件介绍

celda 项目的配置文件主要包括 _pkgdown.yml 和 Rbuildignore。

_pkgdown.yml

_pkgdown.yml 文件用于配置 pkgdown 网站的生成。pkgdown 是一个用于生成 R 包文档网站的工具，_pkgdown.yml 文件中可以定义网站的结构、样式、导航等。

Rbuildignore

Rbuildignore 文件用于指定在构建包时忽略的文件和目录。这些文件和目录不会被打包到最终的 R 包中，通常用于排除不需要的文件，如开发过程中的临时文件、测试文件等。

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以上是 celda 项目的目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望这些信息能帮助你更好地理解和使用该项目。

celda Bayesian Hierarchical Modeling for Clustering Single Cell Genomic Data 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ce/celda