MIMIC-III 数据库安装【Windows】

最新推荐文章于 2025-11-16 17:27:24 发布
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#MIMIC-III #医学数据库 #postgresql

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MIMIC数据库安装及数据导入教程
2301_79250988的博客
08-12 2646
临床医疗数据库mimic的安装使用
MIMIC-IV数据库安装-3.0/3.1
m0_73116852的博客
08-08 4916
7-zip：配置环境变量（安装路径）Postgressql：配置环境变量（安装路径/bin）Navicat。
MIMIC-III 基准测试框架安装与使用指南
最新发布
gitblog_00831的博客
11-16 494
MIMIC-III基准测试框架是一个强大的工具集，用于从MIMIC-III临床数据库构建机器学习数据集，旨在促进医疗领域的数据分析和模型训练。MIMIC-III是大规模重症监护病房(ICU)患者的详细临床数据库，包含了来自多个医院的数据。 该项目提供了多种预处理脚本和模型评估模板，可以方便地进行各种类型的任务，如预测患者结局、疾病分类等。它还支持多任务RNN架构，能够同时解决多项任务并显示其相对
MIMIC-IV数据安装教程
moodfriend的博客
08-31 7727
MIMIC数据安装流程
mimic数据库的安装
zfxgfcjhb的博客
07-20 2386
1.安装postgresql:https://www.postgresql.org/download/windows/ 2.打开psql控制台： 创建用户和数据库名称：create user mimic； create database mimic owner mimic; 连接到mimic数据库：\c mimic 创建模式：create schema mimiciii; 创建数据库中的表：\i E:/data...
mimics安装教程
07-24
适合初学者安装mimics软件时，按照其中的步骤进行软件的安装
Mimic-III 数据库挖掘尝试——连续性肾脏替代治疗（CRRT）
fleame的专栏
01-17 2012
Mimic-III 数据库挖掘探索——连续性肾脏替代治疗（CRRT），零代码提取数据，复现文章。
MIMIC III（windows安装MIMIC III数据库）
热门推荐
shaodongheng的博客
07-02 1万+
文章目录下载MIMIC-III临床数据库和代码安装PostgreSQL安装7-zip运行SQL Shell（psql）创建数据库以保存数据在数据库中创建表准备将数据加载到表中将数据加载到表中建立索引测试您的构建 官网：https://mimic.physionet.org/ 下载MIMIC-III临床数据库和代码 这里是数据库 数据库需要注册学习，才能下载。 下载的压缩包： 这里是代码 安装PostgreSQL PostgreSQL 运行整个安装过程。保留默认设置就行，但是请记下您的postgres密码，
SQL-SHELL中安装mimic-iii数据库报错无法获取文件CHARTEVENTS.csv
Nicklu001的博客
07-13 2879
今天安装了mimic-III数据库，说一下过程中遇到的一些问题： 首先，mimic数据库的数据是需要申请的，这里默认已经下载了。 1、首先安装navicat，是一个很棒的数据库管理和操作工具，但是需要破解激活一下，参考的如下文章: https://www.52pojie.cn/forum.php?mod=viewthread&tid=1142909 2、安装postgresql，这里参照的是MIMIC-III中官网的链接中的步骤(把mimic的安装链接和postgresql的链接都放到这里)
MIMIC-III代码结构和运行
weixin_44157403的博客
03-23 2725
benchmark - 各种指数速度测试 buildmimic - 在关系数据库管理系统 (RDMS) 中构建 MIMIC-III 的脚本，特别是postgres是我们选择的 RDMS concepts - MIMIC-III 中数据的有用视图/摘要，例如人口统计、器官衰竭评分、疾病严重程度评分、治疗持续时间、更易于分
MIMIC IV 3.0数据库安装方法
数说时代
08-08 4215
MIMIC IV 3.0数据库安装方法或者思路如上，其实和MIMIC IV 2.2没有区别。常规的安装方法，会安装且电脑也比较快的话一般需要2-4小时，慢的也有七八小时的情况。idata01全网首创了一种极速安装技术，安装好的数据和官网是完全一样的，但是安装时间只需要10-20分钟，极大的节省了科研人员的时间。
labview读取mimic数据库脉搏波
01-24
MIMIC II波形数据库（The MIMIC II Waveform Database）包含数以千计从床边病人监测器收集的成人和新生儿重症监护室（ICU）信息，记录了波形形式的生理信号和数字形式的生命体征时间序列。一个或多个心电（ECG）信号，连续动脉血压（ABP）波形，指尖光电容积脉搏（PPG）信号，呼吸信号等至多8个同时序的信号。 数字通常包括心率、呼吸速率、血氧饱和度（SpO2）、收缩压、平均值、舒张压，以及其他可用的信息。记录长度也不同，从几个星期到几天，甚至几个小时。压缩包包含labview程序，mimic数据库简介，以及部分脉搏波.dat文件
在Windows上安装MIMIC-III
weixin_44157403的博客
02-24 779
windows安装MIMIC
MIMIC-III的安装
weixin_45081871的博客
03-29 2979
参考文章：MIMIC III（windows安装MIMIC III数据库） 准备工作 1.获取MIMIC中数据 由于MIMIC-III数据有申请限制，所以本文主要是以MIMIC-III的demo来解释。 数据位置：D:\PhysioNetData\mimic-iii-clinical-database-demo-1.4 注意：在后面的sql加载中要改为左斜线。 2.下载Git-Hub中的code，链接 该链接下载速度很慢。 code位置：D:\mimic-code-main\mimic-iii\buil
MIMIC云数据库安装及使用
越吃越胖的博客
12-31 2406
基于阿里云hologres进行mimic数据库组装，该数据库具有强大的性能和计算速度。依次遵循一下步骤可以完成配置。
MIMIC IV数据库安装（二）
傍晚的猫和鱼的博客
09-19 6717
MIMIC IV数据库安装
【MIMICIII 数据库安装】踩坑记录+解决方案
Mocode的博客
05-25 7453
在安装MIMIC III数据库过程中踩到的坑与解决方案记录。
在服务器linux\CentOS上安装mimic数据库
Catherine_G的博客
12-26 2216
在CentOS上安装mimic数据库
mysql与mimic安装_MIMICIII 数据库教程(4)——MIMIC数据库的安装 #丁香打卡#
weixin_33347467的博客
01-27 1933
上一步我们进行到了安装PostgreSQL。这个安装会出现各种问题，从点开安装包，到安装结束，会弹出各种错误的窗口。做好心理准备，一定要耐心，有问题可以在楼下反馈，一起交流。那么这一期进行的就是——把6G的数据包安装好。需要用到的就是postgresql这个软件。这一篇懒得看的话，可以看我做的视频教程:↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑→ 安装postgresq...
mimic数据库
03-18
<think>好的，我现在需要处理用户关于MIMIC数据库的查询。用户想了解如何下载、使用教程以及数据结构。首先，我需要回忆之前提供的引用内容，特别是引用[1]和引用[2]。引用[1]提到了Windows下的安装步骤，而引用[2]详细介绍了用Python读取MIMIC-IV的方法，包括分块读取和使用dask、spark等工具。 接下来，我需要整理这些信息，分点回答下载、教程和数据结构的问题。下载部分需要提到PhysioNet的认证流程，可能用户不知道需要完成培训，这点很重要。然后安装步骤可能需要指导用户如何解压和配置数据库，引用[1]可以作为参考。 使用教程方面，引用[2]提到了Python处理的方法，特别是pandas和dask的使用，还有未来的教程计划，这部分需要强调。数据结构部分需要说明MIMIC-IV的模块，比如hosp、icu等，可能用户不清楚这些模块的具体内容，需要简要说明。 另外，用户可能需要知道如何开始使用，比如从哪些表入手，比如patients、admissions，这些是基础表。同时，处理大型数据集的技巧也很重要，比如分块读取，引用[2]中的方法可以引用。 最后，生成相关问题时要覆盖安装、数据访问、处理技巧和应用场景，这样用户可以有进一步的问题方向。需要确保所有LaTeX格式正确，比如变量用$...$，但可能这里数学公式不多，主要注意代码块的使用。回答要结构清晰，分步骤说明，保持自然的中文表达，同时正确添加引用标识。</think>### MIMIC数据库的下载、使用与数据结构详解 #### 一、MIMIC数据库下载 1. **访问权限申请** MIMIC数据库需通过PhysioNet平台申请，需完成CITI认证（伦理培训）并签署数据使用协议[^1]。 - 访问PhysioNet官网：https://physionet.org/ - 注册账号并提交“Credentialed Access”申请 2. **安装与配置** - Windows环境下可通过优快云教程《MIMIC-III 数据库安装》逐步操作，包括数据解压、PostgreSQL数据库配置等。 - 数据文件通常包含多个CSV表格，需按脚本导入数据库。 --- #### 二、使用教程与数据处理 1. **Python读取MIMIC-IV数据** ```python import pandas as pd # 分块读取超大CSV文件（适合内存不足场景） chunk_iter = pd.read_csv('mimiciv/icu/chartevents.csv', chunksize=10000) for chunk in chunk_iter: process(chunk) # 自定义处理函数 ``` - **高效工具推荐**： - `pandas`分块读取（`chunksize`参数） - `dask`分布式处理（适合TB级数据） - `PySpark`（集群环境适用）[^2] 2. **核心操作步骤** - **数据探索**：从`patients`、`admissions`表开始，关联临床事件表（如`labevents`）。 - **字段筛选**：使用`usecols`参数减少内存占用。 - **时间序列处理**：重点关注`charttime`字段的时序对齐。 --- #### 三、数据结构（以MIMIC-IV为例） MIMIC-IV分为多个模块，核心结构如下： | 模块 | 主要表格 | 关键字段示例 | |-----------|------------------------------|--------------------------------| | `hosp` | `patients`, `admissions` | `subject_id`, `gender`, `admittime` | | `icu` | `icustays`, `chartevents` | `stay_id`, `itemid`, `valuenum` | | `lab` | `labevents`, `d_labitems` | `specimen_id`, `loinc_code` | - **典型关联关系**： 患者（`patients`）→ 入院记录（`admissions`）→ ICU停留记录（`icustays`）→ 生理指标（`chartevents`）[^2] ---
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