34、从蛋白质相互作用及序列数据中挖掘结合基序对

从蛋白质相互作用及序列数据中挖掘结合基序对

在生物学研究中，理解蛋白质之间的相互作用对于揭示生命过程的奥秘至关重要。结合基序对的发现能够为我们提供关于蛋白质相互作用的详细信息，有助于新药的研发。下面将详细介绍从蛋白质相互作用序列数据中发现结合基序对的方法。

最大接触片段对的检测

首先，我们需要从蛋白质复合物中检测最大接触片段对。其代码逻辑如下：

if (COv([xil , xiz]) n [yj,, yj,]) == [yj, , yj,] then 
    if (Cov([yj,, yj,]) n [xi,, x i Z ] )  == [xil, xi,] then 
        Output the segment pair. 
        Add ([yj, , yj,], [xil, xi,]) into the candidate list. 
    else 
    end if 
    Split Cov([zi,, xi2]) n [yj, , yj,] into w number of continuous sub - segments, denoted [ykzt - ,, ykzt], t = 1....w, put each segment pair 
    ([ykzt - ,, ykat], [xi,, xiz]), t = 1...w, into the candidate list. 
else 
end if 
until The candidate list is empty.

这个算法会不断处理，直到候选列表为空。