纵向数据与计算网格:技术解析与应用探讨
1. 纵向数据处理
1.1 获取模型与进一步分析
在处理纵向数据时,有时我们从基于生物学考虑而非数据得出的模型入手,通过在优化中加入“常识”先验来采用贝叶斯方法。但很多时候,我们事先对可能的模型了解有限,从数据导出的模型参数含义也不易理解,制定先验并非易事。
面对不完整且嘈杂的数据,我们可以采用一种常见的中间方法:先使用精心整理的训练集来建立模型并定义先验,再将模型应用于通常更大、更嘈杂的数据集。训练集可以来自更精确(更昂贵)的测量或试点研究。具体操作步骤如下:
1. 研究特定领域模型 :查看是否有适用于数据的特定领域模型,若有,通常能得到一个带有有意义先验的明确模型。
2. 考虑专业软件 :若工作重点是对纵向数据进行建模,尤其是考虑其他协变量、组或层次结构时,可以考虑使用像 Stan(www.http.mc-stan.org)这样的专业软件包。它允许用专业建模语言创建复杂模型,并提供直接的图形反馈,方便对模型进行调整。
3. 采用简单方法 :
- 数据平滑 :使用少量预定义节点的 B 样条对数据进行平滑处理,得到一组固定的参数来描述每条曲线。
- 数据对齐 :在某些特征(如曲线的最大值或一阶导数)处对齐(移动)数据。
- 数据归一化 :通过减去平均曲线对数据进行归一化。
- 主成分分析 :对残差曲线的参数
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