nrrd格式的读取

最新推荐文章于 2025-06-21 18:42:40 发布
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分类专栏： Medical Image Processing 文章标签： nrrd
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本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/fignting_formyself/article/details/80272219
本文介绍了NRRD格式的结构和版本历史，包括其头文件内容，如dimension、type、encoding和space信息。讲解了如何读取NRRD文件，特别是处理数据文件和头文件的分离，以及在不同平台上的区别。提到了Gzopen函数无法直接读取NRRD数据，需要先解压缩。并建议使用Teem库的unu命令行工具来获取文件头信息和进行数据处理。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

1.NRRD文件
NRRD文件介绍官网    http://teem.sourceforge.net/nrrd/format.html

灵活的NRRD格式包含了一个单独的头文件和若干个可以被结合在一起或者分开的图像文件。NRRD头文件为科学可视化和图像处理准确地表征了N维光栅信息。

NRRD格式表征扩散加权图像(DWI)体积和扩散张量图像(DTI)。

为了目视确认张量的方向和期望的神经解剖学的结构一致，NRRD DWI 和 NRRD DTI 数据能够被读取为 3D 切片。

Ø  Magic

NRRD0001: 初始和最基本的版本

NRRD 0002 : 增加key/value 对(键值对)

NRRD 0003: 增加“kinds”：field

NRRD 0004 : 加入“thicknesses”和“sample units”，added "thicknesses:" and "sample units" fields,general space and orientation information ("space:", "spacedimension:", "space directions:", "space origin:", and"space units:" fields) , and the ability for the "datafile:" field to identify multiple data files.

NRRD 0005: 加入“measurement frame”

Ø 

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医学影像中用 python 读取 nrrd 文件，nrrd转nii，以及遇到的一些问题和解决方法
Admiral_x的博客
03-27 8293
DICOM, NII, NRRD 格式的文件是医学影像中处理文件遇到的常用格式，但是关于这方面的内容比较少，我自己在处理图像的过程中遇到了相关的问题，但是没有找到和我直接一模一样的问题，也没有相关的解决方法，所以我在有了解决想法之后，决定将我的想法分享出来。
用python实现文件的读取
11-04
如何实现试用python实现文件的读取import sys,random import getpass filename = sys.argv[0] f=open(filename,'r',encoding='utf8') line_no=0 with open(filename,'r',encoding='utf8') as f: for line in f: line_no+=1 print(line_no,':',line) f.close()
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05-29
我一直在逐步为 Matlab 文件交换的现有贡献添加功能，并认为结果可能对其他人有帮助。 新的编写器模块（nhdr_nrrd_write.m）应该与读取器模块（nhdr_nrrd_read.m）兼容，因为一个模块的输出可以作为另一个模块的参数提供，以读取或生成有效的.nhdr / .nrrd文件。 只要有可能，就会发出有用的错误和警告。 NRRD 格式兼容性 一些支持的 NRRD 功能： - 带有“数据文件：”的所有变体的分离标题- 原始、txt/text/ascii、gz/gzip 编码- 空间和方向的定义- 使用 ':=' 行处理扩散加权 MRI 数据，例如 'modality:=DWMRI', 'DWMRI_b-value:=' and DWMRI_gradient_0000:=', 'DWMRI_gradient_0001:=', 'DWMRI_grad
matlab读取nrrd格式文件
03-09
用matlab读取nrrd格式文件，支持raw和gzip编码
SimpleITK——创建nrrd体素模型
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bianguanyue的博客
06-21 347
在介绍如何生成nrrd前，了解一下为什么医学影像上一般使用nrrd的体素模型？
读取.nrrd和.dcm文件格式医学图片可视化与预处理
fcxgfdjy的博客
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MITK默认会将医学图像保存为格式为NRRD的图像，在这个数据格式中包含：1、一个单个的数据头文件：为科学可视化和医学图像处理准确地表示N维度的栅格信息。2、既能分开又能合并的图像文件。nrrd_options输出{u’dimension’: 3, # 维度u’encoding’: ‘raw’, # 编码方式u’kinds’: [‘domain’, ‘domain’, ‘domain’], # 三个维度的类型u’sizes’: [30, 30, 30], #三个维度的大小。
医学影像中用 python 读取 nrrd 文件、nrrd转nii、nrrd转h5
紫芝的博客
09-26 1万+
用 python 读取 nrrd 文件一般使用 pynrrd 这个库 1 安装pynrrd pip 安装 pip install pynrrd 源码安装 pip install git+https://github.com/mhe/pynrrd.git cd pynrrd pip install . // 注意不要忘了最后的小点 2 读取 nrrd 文件 //先导入 nrrd 库 import nrrd data_path=r'你自己的 nrrd 文件路径’ data,options=nrrd...
医学图像笔记（二）nrrd数据格式
juluwangriyue的博客
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医学图像笔记（二）nrrd数据格式1、nrrd数据格式2、python读取nrrd数据 1、nrrd数据格式 灵活的NRRD格式中包含了一个单个的数据头文件和既能分开又能合并的图像文件。一个NRRD数据头能够为科学可视化和医学图像处理准确地表示N维度的栅格信息。“国家医学图像计算联盟”（NA-MIC）开发了一种用NRRD格式来表示“扩散加权图像”（DWI）和“扩散张量图像”（DTI）的方法。NRRD的“扩散加权图像”和“扩散张量图像”数据可以被解读为一个“3D切片机”，能够直观地确定张量图像的方向与神经解剖
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nrrd文件read，另存为mat, matlab
ok8821428的专栏
01-06 1414
path1 = 'E:\***\'; path2 = 'E:\***\'; imgname = '**1.img.nrrd'; segname1 = '**1.seg.nrrd'; segname2 = '**2.seg.nrrd'; segname3 = '**3.seg.nrrd'; files = dir(strcat(path1,'*.*')); len=length(files); for i=26:len i pathname=files(i).name; oldpa.
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