里清外明-优快云博客

对于单个图像，使用官方默认的推理方式会比较慢，而且在测试阶段推荐先用cpu而不是gpu进行推理，对于大批量的图像推荐使用官方默认的推理方式，且使用gpu。下面的代码同样根据官方给的示例进行调整得到推理单个2D图像的代码。相比默认的推理方式，这里支持图像名不以_0000.png结尾。为了方便人查看预测的效果，增加了恢复自定义的标签值模块。

2024-09-24 18:29:13 357

原创 nnunetv2系列: 导出模型参数文件和配置文件成zip压缩包

根据命令在文件中查找到信息，那么在文件中可以看到定义的相关的参数和默认值。我们也可以通过命令直接获取相关的参数信息。这里仅提供五折中的一折的模型参数文件和配置文件，如果需要全部的模型参数文件和配置文件，需要修改命令中的-f参数，默认是五折。

2024-09-13 07:00:00 294

原创 nnunetv2系列:解压zip文件到nnunet默认路径

这个命令的功能是将zip文件解压到路径下的指定位置，用于后续推理使用。在新的电脑上面使用同样需要安装nnUNet库以及配置环境。根据命令在文件中查找到信息，那么在文件中可以看到定义的相关的参数和默认值。我们也可以通过命令直接获取相关的参数信息。

2024-09-12 07:30:00 194

原创 nnunetv2系列：2D实例分割数据集转换

这里主要参考官方源文件，注释了一些不必要的操作。数据集下载链接:nnU-Net只能用于使用无损(或无)压缩的文件格式!因为文件格式是为整个数据集定义的(而不是单独为图像和分割定义的，这可能是将来的任务)，我们必须确保没有破坏分割映射的压缩工件。所以没有。jpg之类的!支持的2D数据集文件类型包括。

2024-09-11 19:25:16 1250 1

原创 nnunetv2系列：预测掩码可视化

实例分割的掩码输入的值，一般都得转成0， 1， 2这样的数值，预测出来后人无法直接可视化查看结果，这里给出代码示例，根据自定义的值进行转换，适合单通道灰度图和三通道彩色图。

2024-09-11 07:30:00 349

原创 nnunetv2系列：使用默认的预测类推理2D数据

这里参考源代码中给的示例进行调整和测试。

2024-09-10 20:50:49 991

原创 nnunetv2系列：torch转onnx

作者提供的代码，这里做了一些简单的调整和优化，原代码存在覆盖文件问题。

2024-09-10 20:41:06 561 4

原创 # X-AnyLabeling系列：多类别三通道掩码转多边形坐标点

整体与类似，主要是单类别单通道掩码改为多类别三通道掩码。

2024-08-23 19:31:37 385

原创 X-AnyLabeling系列：多类别单通道掩码转多边形坐标点

整体与类似，主要是单类别单通道掩码改为多类别单通道掩码。

2024-08-23 19:22:49 481

代码参考:中的.\X-AnyLabeling\ tools\polygon_mask_conversion.py。这里主要拆分出多边形坐标点转掩码，同时增加了参数和支持带有中文名的路径。多边形坐标点存储在json文件中，格式可参考X-AnyLabeling中给出的示例，下面也给出一个具体的简单示例。掩码转多边形坐标点部分可参考另外一篇博客:https://blog.youkuaiyun.com/familytaijun/article/details/141401587。

2024-08-21 20:10:18 852