nipype处理核磁数据(二)——FSL、FreeSurfer的安装

最新推荐文章于 2025-05-30 15:15:16 发布

faceSunshine

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分类专栏： nipype处理核磁数据文章标签： Ubuntu FSL FreeSurfer

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/faceSunshine/article/details/78592053

本文详细介绍了在Ubuntu环境下，如何安装和配置FSL与FreeSurfer这两个核磁数据处理工具。首先，通过NeuroDebian安装FSL，并配置环境变量以确保正常使用。接着，从官方网站下载FreeSurfer的安装包，完成解压及许可证配置，并调整环境变量。最后，通过简单的测试命令验证两个软件的安装是否成功。

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nipype处理核磁数据(二)——一些插件的安装

1.FSL

第一步：安装

在安装成功NeuroDebiian后，直接在终端输入下列语句，过程中y/n选择均选y。

sudo apt-get install fsl

第二步：配置环境变量

利用终端调出.bashrc文件，在文件末尾添加下列代码并保存

#FSL
FSLDIR=/usr/share/fsl
. ${FSLDIR}/5.0/etc/fslconf/fsl.sh
PATH=${FSLDIR}/5.0/bin:${PATH}
export FSLDIR PATH

第三步：检测在终端输入fsl,出现下图就成功了。版本信息可以改变

2.FreeSurfer

第一步：安装包

①.下载地址：http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/Download

②.拷贝安装包(freesurfer-Linux-centos6_x86_64-stable-pub-v6.0.0.tar.gz)到/usr/local目录并解压

#copy to /usr/local
cd /home/username/donwloads
sudo cp freesurfer-Linux-centos6_x86_64-stable-p

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