本文主要通过生信人-SangerBox;EXCEL(2010版以上)和AI三个软件进行绘制Heatmap相关性热图。
sangerbox下载地址(免费):http://sangerbox.com/;sangerbox官网:https://shengxin.ren/,学习软件使用及其他视频教学(部分收费)。
- 相关性分析批量计算:
准备数据及表格规范化:横表头为样品编号,纵坐标为环境因子。注意两个矩阵的横表头要为样品编号。
- 选择“批量计算相关系数工具”-进行相关性计算(P值与R值)
3. 加载处理好的表格(txt格式),选择r>0.5,p>0.05,选择文件—保存结果的位置-成功导出-结果有3个txt文件,其中不是原上传表格的就是我们想要的相关性分析结果。