本文主要通过生信人-SangerBox;EXCEL(2010版以上)和AI三个软件进行绘制Heatmap相关性热图。
sangerbox下载地址(免费):http://sangerbox.com/;sangerbox官网:https://shengxin.ren/,学习软件使用及其他视频教学(部分收费)。

- 相关性分析批量计算:
准备数据及表格规范化:横表头为样品编号,纵坐标为环境因子。注意两个矩阵的横表头要为样品编号。


- 选择“批量计算相关系数工具”-进行相关性计算(P值与R值)

3. 加载处理好的表格(txt格式),选择r>0.5,p>0.05,选择文件—保存结果的位置-成功导出-结果有3个txt文件,其中不是原上传表格的就是我们想要的相关性分析结果。

根据得到的P值(显著程度)与R值(相关程度),我们在EXCEL上进行初步绘图,再用AI进行数字去除和显著性添加:
详细步骤参考链

本文介绍了如何不使用R语言,而是通过SangerBox、Excel(2010版以上)和Adobe Illustrator来创建相关性热图。首先在SangerBox中进行批量相关性计算,然后在Excel上初步绘图,最后通过AI完成数字去除和显著性标注。
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