1、碳水化合物与蛋白质相互作用及组织工程应用研究

碳水化合物与蛋白质相互作用及组织工程应用研究

1. 碳水化合物与蛋白质相互作用的研究背景与意义

碳水化合物与蛋白质的相互作用在众多生物过程中起着基础性作用。这些过程涵盖了健康细胞间和组织内的通讯、病毒进入宿主细胞（感染）以及致病细菌在特定环境中定殖并逃避免疫系统检测的机制等。然而，由于碳水化合物 - 蛋白质相互作用本质上较弱，碳水化合物（糖）部分在这些过程中的确切作用仍知之甚少，且难以厘清。

2. 碳水化合物 - 蛋白质相互作用的研究方法与成果

• 生物信息学分析 ：对整个蛋白质结构数据库（PDB）中的碳水化合物 - 蛋白质相互作用进行了详细的生物信息学分析。这一研究不仅为他人提供了特定碳水化合物 - 蛋白质相互作用的注释集以供研究，还揭示了蛋白质如何识别和区分不同的糖类。研究从物理化学角度，特别是与相互作用伙伴静电特性相关的 CH - π 相互作用来解释研究结果，这与经典的疏水效应不同，并挑战了关于稳定碳水化合物 - 蛋白质相互作用的主流观点。相关研究成果于 2015 年发表在《美国化学会志》上，后续还证明了这些弱的非共价 CH - π 相互作用在更广泛的蛋白质结构稳定和特异性方面发挥着重要作用，该成果于 2017 年发表在《自然化学生物学》上。
• 研究流程 ：
  1. 确定碳水化合物身份 ：使用 GlyVicinity 工具确定蛋白质结构中碳水化合物的身份。
  2. 解析输出结果 ：对 GlyVicinity 的输出进行解析。
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