28、R和Python中的层次聚类及相关算法解析

R和Python中的层次聚类及相关算法解析

1. R中的层次聚类

在R语言中，有许多用于聚类的函数，分布在 cluster 、 dbscan 、 stats 、 parallel 等包中。其中， stats 包中的 hclust 函数（也可通过 clust 包访问）可对一组相异度数据进行层次聚类分析。

1.1 hclust 函数的使用

hclust 函数的典型用法如下：

hclust(d, method = "complete", members = NULL)

• d ：由 dist 函数生成的相异度结构。
• method ：使用的聚合方法，可选值包括 "ward.D" 、 "ward.D2" 、 "single" 、 "complete" 、 "average" 、 "median" 或 "centroid" 。
• members