dcm2niix批处理

批处理前文件夹中文件导出为txt文件，终端里输入ls>文件名.txt

#!/bin/bash
dir=/mnt/H:/xsp/T1nii
dir_hc=/mnt/H:/xsp/hc
dir_sp=/mnt/H:/xsp/sp
for sub in `cat /mnt/H:/xsp/hc/hcyw.txt`
do
	echo ${sub}
	mkdir -p ${dir}/${sub}/T1
	cp ${dir_bd}/${sub}/T1/* ${dir}/${sub}/T1/ || cp ${dir_bd}/${sub}/t1/* ${dir}/${sub}/T1 || cp ${dir_bd}/${sub}/*_t1_mprage_sag_iso_mww64CH/* ${dir}/${sub}/T1/
	cd ${dir}
	dcm2niix -o ${dir} -f %f ${dir}/${sub}
done


##挂在H: sudo mkdir /mnt/H:/; sudo mount -t drvfs H: /mnt/H:/
##ls>hcyw.txt