生物信息分析时常用linux操作命令

探序基因肿瘤研究院   整理

1. 一个每一行都是编号的列表中，去除重复的编号

sort xxx.allnumber.txt | uniq > xxx.allnumber.uniq. txt

2. 提取表格的指定列，并要给定顺序显示，分隔符为\t

awk '{print $2"\t"$3"\t"$1}' aaa.txt

3. bed文件坐标加1。例如将bed文件最后一列坐标加1

 awk '{print $1"\t"$2"\t"$3+1}' xxx.bed

参考：

awk取行取列