sbatch提交作业

sbatch

创建一个待运行的脚本保存为su.sh

#!/bin/bash
/usr/local/bin/Rscript ~/XXX_.R > XXX.out

使用sbatch提交到计算节点

sbatch -N 2 -p c-4-1 -n 8 -c 1 su.sh

sbatch命令的一些常用选项：

参数 功能
-N 申请的节点数量
-p 指定计算节点规格，使用sinfo查看所支持的规格
-n 指定任务数，即并行程序运行多少个进程
-c 每进程使用的cpu核心数
-q 指定队列类型，列如：-q eco 指定使用经济型队列，如果队列未开启经济型，则启动标准型
查看SLURM集群正在运行的作业；

提交示例：

使用2个4核心节点启动8个并行任务。
sbatch -N 2 -p c-4-1 -n 8 -c 1 demo.sh

1个4核心节点启动4个并行任务。
sbatch -N 1 -p c-4-1 -n 4 -c 1 demo.sh

1个4核心节点启动4个并行任务。
sbatch -p c-4-1 -n 4 demo.sh

1个4核心节点启动1个并行任务, 该任务使用4个cpu核心。
sbatch -p c-4-1 -n 1 -c 4 demo.sh

2个4核心节点启动2个并行任务, 每个任务使用4个cpu核心。
sbatch -p c-4-1 -n 2 -c 4 demo.sh

squeue

查看运行作业详细信息

scontrol show jobs

取消程序运行，释放分配的计算节点

scancel JOBID

https://www.bkunyun.com/helpce/docs/2032/about