生物信息学中的建模与模式匹配
1. 人类疾病基因的直系同源物
在生物研究中,了解人类疾病基因在不同生物中的直系同源物是非常重要的。以下是一些人类疾病基因在酵母、秀丽隐杆线虫和黑腹果蝇中的可能直系同源物情况:
| 疾病(基因) | 酵母 | 秀丽隐杆线虫 | 黑腹果蝇 |
| — | — | — | — |
| 共济失调毛细血管扩张症(ATM) | + | + | + |
| 甘油激酶缺乏症(GK) | + | + | + |
| 遗传性非息肉病性结肠癌(MLH1 或 MSH2) | + | + | + |
| 威尔逊病(WND) | + | + | + |
| 杜氏肌营养不良症(DMD) | - | + | + |
| 马凡综合征(FBN1) | - | + | + |
| 2 型神经纤维瘤病(NF2) | - | + | + |
| 2 型多囊肾病(PLK2) | - | + | + |
| 多种癌症(p53) | - | - | + |
| 1 型多发性内分泌肿瘤(MEN) | - | - | + |
| 1 型神经纤维瘤病(NF1) | - | - | + |
| 青少年帕金森病(parkin) | - | - | + |
从这个表格中,我们可以看出不同疾病基因在不同生物中的分布情况,这有助于我们通过研究这些模式生物来深入了解人类疾病的发病机制。
2. 概率建模
由于生物序列具有不规则的可变性质,概率建模成为数据分析中不可或缺的元素。以下是几种常见的概率建模方法:
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