生物信息学中的结构生物信息学概述
生物信息学在现代生命科学领域中扮演着至关重要的角色,它融合了计算机科学、生物学等多学科知识,旨在解决生物学中的复杂问题。而结构生物信息学作为生物信息学的一个重要分支,专注于研究大分子的结构,尤其是蛋白质结构。
1. 生物信息学简介
生物信息学面临着将海量生物数据转化为有用信息和有价值知识的挑战,即知识发现。其关键目标之一是识别和解读隐藏在海量遗传及其他生物数据中的有趣模式,这涵盖了从生物序列中识别有用的基因结构、从实验数据中推导诊断知识以及从文献中提取科学信息等方面。
生物信息学技术是一个跨学科领域,它自然地从计算机科学和生物学中演化而来。其发展涉及以下多个功能方面:
- 生物数据收集 :如NCBI(http://www.ncbi.nih.gov/)、GeneBank、DDBJ和PDB等。
- 生物数据创建 :例如人类基因组计划、基因发现和基因表达等。
- 生物数据库 :像EMBL、EMBI和SWISS - PROT等。
- 生物数据管理 :包括生物信息学数据仓库和序列检索系统(SRS)。
- 生物数据结构 :如结构生物信息学。
- 生物建模 :包括HMM、比较建模、概率建模和分子建模等。
- 生物数据分析与探索 :如生物信息学数据挖掘,以及生物理解,如机器学习、模式匹配和生物序列可视化等。
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