五个网站查物种基因组大小

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动物基因组大小（需翻墙)
植物已测序的基因组大小
真菌基因组大小
原核生物基因组大小
5.NCBI怎么缺呢
注：若如，可要查近源种

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基因组大小查询（二）|基因组组装结果查询

bioyigene的博客

09-18

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查询方法如下：选择数据库“taxonomy”，输入物种拉丁名，查看本物种不同分类水平上物种有哪些物种已经有基因组发布，查询到有基因组信息的物种后，复制物种名称，按照最开始讲到的方法（图2-3）进入到基因组的详细描述页面，就可以看到此近源物种基因组信息（包括基因组大小）。对于已经测序发表的基因组，可以直接通过查询相关数据库中提交的基因组信息，对本物种或者近源物种基因组大小进行初步调研。如果需要参考基因组用于相关数据的有参分析，点击物种查询结果中对应种名，进入下载页面进行基因组及gff文件的下载即可。

生物信息神奇网站系列（十四）：基因组大小统计

xxxie_的博客

07-17

3430

基因组大小是生物一个明显的特征，一般来说越复杂的生物基因组大小越大，例如哺乳类大于鸟类，鸟类大于真菌，原核生物大于病毒。因为越复杂的生物需要越多的基因完成功能，不过也有很多特例，例如植物由于是多倍体，基因组大小可能非常大。知道一个物种，就可以对基因组复杂程度以及测序数据大小有个预估，这个指标还是很有意义的。目前已经测序出很多物种，当然可以通过基因组序列得到，也有一些网站收集已知物种基因组大小，方便...

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如何查找某个物种的基因组大小

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今天，一位老师问我一个问题：猪的基因组大小是多少？我知道大约是2.5Gb，但是怎么查找呢？这里介绍一个通用的方法，对于某个物种，如何查看它的基因组大小呢。 1. 百度翻译走起比如猪的英文，你不知道是什么，查一下：我们知道了，它的英文名是pig 2，进入NCBI官网 NCBI官网：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 3，选择基因组（genome）数据库 键入pig，查询 4. 查看pig的界面猪的基因组大小为：2458.64Mb 5. 试试猫的基因组大小 基因组

【干货指南】如何查找及选择研究物种的参考基因组

Orange_Yang123的博客

09-03

1541

2）若有多个版本，如何评估不同版本或特定品系基因组之间的优劣？GENCODE是由美国国家人类基因组研究所（NHGRI）与欧洲分子生物学实验室（EMBL）共同建立的，旨在通过整合美国国家生物技术信息中心（NCBI）等权威数据库资源，并结合严格的实验验证，系统性地构建和维护人类及小鼠基因组的高精度、高质量注释信息数据库。4、项目信息表填写：可直接从浏览器地址栏复制当前网页链接填入信息表相应位置或者点击页面内的"FTP"按钮，跳转至文件下载目录，在文件列表中找到目标文件，右键点击文件，选择"复制链接地址"。

物种基因组大小查询之流式结果查询

bioyigene的博客

09-11

1164

已经进行基因组测序的物种就更加稀少：截至目前，只有不到15000个物种的基因组为我们所知，其中大部分还是微生物，已经完成测序的真核生物物种只有2534个，只占已知真核生物总数的不到0.2%（数据来源：Scientific American，2018）。对于已经测序发表的基因组，可以通过相关基因组数据库查询（待下期讲解）。该网站使用简单，输入需要查询物种的任一/几种组合信息（物种分类级别、物种名称（属名、种名、通用名称）、C-value范围、实验检测方法等），点击搜索按钮，即可获取物种C-value信息。

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生物信息神奇网站系列（二十）：已发表植物基因组列表

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上一次推送中我们介绍了已发表动物基因组，植物同样重要。目前已经有很多熟知的粮食蔬菜水果类等植物基因组发表出来，也包括很多重要经济作物等。例如水稻，玉米，高粱，大豆，小麦，土豆，白菜，西红柿（别拿我不当蔬菜），甘蓝，苹果，西瓜，梨等等。同样还是在维基百科有详细列表，可以通过这个网址查看已发表植物基因组。二十：已发表植物基因组 https://en.wikipedia.org/wiki/List_o...

用k-mer分析进行基因组调查：（四）用GenomeScope评估基因组特征

qq_40569830的博客

06-16

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介绍GenomeScope，用GenomeScope做基因组调查(genome survey)的基因组特征评估。用GenomeScope1.0评估二倍体物种的基因组大小、杂合度、重复率等基因组特征，用GenomeScope2.0评估多倍体物种的基因组大小、杂合度、重复率、基因型比例和基因组结构(同源/异源多倍体)等基因组特征，用Smudgeplot估计物种的倍性。...

可以下载genome数据的几个网站

薛猫_柳叶刀

03-26

3634

Ensembl-plant ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub/ Ensembl-animal ftp://ftp.ensembl.org/pub/ NCBI: ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genomes UCSC: http://hgdownload.soe.ucsc.edu/downloads.html 植

生物信息神奇网站系列（十九）：已发表动物基因组列表

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1868

随着测序的普及，越来越多的动物基因组被测序出来，目前已知就包括人类，大熊猫，猪，牛，绵羊，马，鸡，白鳍豚，藏羚羊，青蛙，牦牛等等物种。目前维基百科有专门页面用于公布已发表动物基因组，而且还在不停添加中。我们在文章尾部为大家提供了一份中文版的已发表动物的表格。十九：已发表动物基因组列表 https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_sequenced_animal_g...

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最近在看生信宝典的书籍，无意中发现了这个： EVEX在线查询数据库（http://evexdb.org/）是一款以基因为检索对象，以PubMed和PubMed Central中发表文章的摘要和全文为依据的文本挖掘（text mining）数据库。由于检索结果都是以被检索的基因为中心，因此条理非常清晰。输入一个gene，可以看到与之相关的有四类基因继续点开后可以看到支持这一调节关系的原文。...

如何使用NCBI查找已知基因的相关信息

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原文来源链接：http://www.dxy.cn/bbs/topic/25111987 转载于:https://www.cnblogs.com/fangfang66/p/10411084.html

鸿蒙系统解析文献,david数据库能做哪些物种的功能注释

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满意答案月季1682013.08.09采纳率：52%等级：9已帮助：862人现代生物研究中的高通量技术如microarray、蛋白质组学或NGS能够让科学家们检测到几乎所有的mRNA，蛋白质或DNA序列的变异，从而获得成千上万的数据。分析数据结果的复杂程度和所需要的时间也随之直线上升，科学家们往往会陷入如何从海量的实验数据中挖掘到该体系到底发生了什么的泥潭中。想充分挖掘实验数据中的价值，需...

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