使用Champ包分析差异基因报错，请问怎么解决

最新推荐文章于 2024-08-09 07:39:25 发布
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#生信分析

本文开始对比分析两组数据，旨在寻找差异甲基化的CpG位点。通过构建对比矩阵，设定对照组，进行NA处理及p值计算。然而，在使用contrast.fit函数进行拟合时遇到错误，提示对比中不允许存在NA值。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

[ Section 2: Find Differential Methylated CpGs Start ]

Start to Compare : 1, 2
Contrast Matrix
Contrasts
Levels NA-p
p NA
Error in contrasts.fit(fit, contrast.matrix) :
NAs not allowed in contrasts.

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