signalp6 分泌信号肽预测——全基因组级、宏基因组级分泌表达预测

基于DTU最新的signalp6神经网络预测架构，搭建本地（离线版）蛋白分泌信号肽预测预测平台，基于此，可进行无序列数限制的、批量的、精准蛋白分泌预测；

目前dtu官方已经更新到了signalP6 （Version 6），可对细菌、真菌的全基因组蛋白是否为分泌表达进行方便预测，结果准确性高，可靠性强；是目前（2024.12）为止，最精准的预测工具之一。

DTU虽然也提供了在线的免费版本，供全球用户使用，但由于是完全免费，使用人数众多，对每用户提交的序列数量也是有很大限制；且有超时设置，超时即任务失败，需要重新提交。

重点信息：在线版地址为
https://services.healthtech.dtu.dk/services/SignalP-6.0/

单机版，则可根据自己分析数据量的大小，以及自己学习的需求，自行安装（官网有提供相应的下载方法及下载地址）

这对于具有批量序列预测的用户来说，无疑会降低工作效率；在效率为王的时代，时间成本往往高于其他资源。花小钱解决大问题，还是很值的选择。

而单机版，由于采用了在线版相同的预训练模块，预测结果与在线版完全一致；

且由于是在自己的电脑上面运行，不存在蛋白序列条数限制，可以极大地提高全基因组级蛋白序列、宏基因组级蛋白序列的批量分泌表达预测；从而减少在这些基础、重复的事情上消耗的报给时间。

signalp6分泌信号肽预测，可直接处理全基因组级、宏基因组级批量预测；
为蛋白外分泌、效应蛋白的筛选打下第一部基础；
之后再根据跨膜分析、亚细胞定位等工具，可做到外分泌蛋白/效应蛋白预测方面的精准分析；
最终得到经得起试验验证的数据。

序列越多，耗时越长，则相应的消耗的运算资源越久；而结果整理汇总时，需要的时间也就越久。因此，不同的基因组大小，不同的基因组数量，不同蛋白序列数，在进行分析预测时，消耗的系统资源也就各不相同；

但总的来收，只要你的电脑/工作站/服务器配置足够高，那就可以提供足够快的分析服务，在更短的时间内得到你想要的数据。

////||||\\\\分析—某鱼 检索 “ Interpro Pfam蛋白功能重批注—可开发P ”
////||||\\\\分析—某鱼 检索 “ 蛋白表达亚细胞定位分析；全流程，可开发P ”
////||||\\\\分析—某鱼 检索 “病毒蛋白亚细胞定位 ”
////||||\\\\分析—某鱼 检索 “Enzyme function prediciton using constrative learning 可开发P ”
////||||\\\\分析—某鱼 检索 “signalp6 分泌信号肽预测 可开发P ”
////||||\\\\分析—某鱼 检索 “全基因组间序列比对，找差异表达序列 ”
////||||\\\\分析—某鱼 检索 “ 序列进化树作图，系统进化树作图； ”
////||||\\\\分析—某鱼 检索 “ pacbio测序数据分析，功能酶挖掘，可开发P ”