15、基于实体增强双塔神经网络的用户友好型药物映射研究

基于实体增强双塔神经网络的用户友好型药物映射研究

1. 引言

对于没有专业医学背景的患者来说,药物名称往往难以发音和记忆。在与Alexa等对话式代理交流药物名称时,缺乏医学背景的患者可能会用多种不同方式提及药物,比如布美他尼(Bumetanide),既可以用通用名,也可以用商品名布美他(Bumex),还能用“高血压药丸”(疾病名称)来指代。而有医学知识的患者则可能使用缩写或专业术语来称呼药物,例如用“免疫药物”指代处方中的“霉酚酸酯盐酸盐”。

本文聚焦于根据患者的描述(DMP:描述性药物短语),从患者正在服用的药物列表中找出通用药物名称(SMN:标准化药物名称)这一问题。与传统的医学概念归一化不同,此问题针对的是患者特定的处方列表,而非通用的概念列表。

我们将其构建为一个排序问题,对患者正在服用的所有药物根据与患者描述的关系进行排序,排名最高的即为推断结果。同时,我们提出了一种基于硬注意力的实体增强CNN架构,相较于早期的排序方法,准确率提升了4%。此外,利用模型的潜在输出,我们构建了一个药物聚类系统,将具有相似效果和治疗相似疾病的药物归为一组,这有助于医生考虑替代药物以降低成本,也能帮助患者区分那些在印象中相似但实际使用条件不同的药物。

我们的主要贡献如下:
- 提出了一种医学实体增强架构——药物推断模型(MIM),相较于强大的BERT基线模型,准确率提高了7% - 9%。
- 与最先进的排序架构进行基准测试,证明了我们工作的稳健性。
- 展示了药物聚类结果,将具有相似效果和治疗相似疾病的药物归为一组。

2. 任务定义

每个示例表示为一个元组 (Q, P1, P2, …, Pn, Y)

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