Elastix配准工具使用入门

本文介绍了Elastix,一个基于ITK的医学图像配准工具,包括其概念、开源性质和模块化设计。通过下载并运行Elastix的示例,展示了如何进行配准操作。详细讲解了example.bat脚本和参数文件的使用,阐述了刚性与非刚性配准的效果。最后提到了Elastix参数文件的定制和资源分享。

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Elastix介绍

首先根据Elastix官方手册上所写:

elastix. The software consists of a collection of algorithms that are commonly used to solve medical image registration problems. A large part of the code is based on the Insight Toolkit (ITK).The modular design of elastix allows the user to quickly test and compare different registration methods for his/her specific application. ——elastix_manual_v4.7

Elastix是一个基于ITK开发的处理医学图像配准问题的工具。关于什么是医学图像配准,我会再做其他介绍,这里就认为找到Elastix的人都已经有所了解。Elastix提供了很方便的命令行使用方式以供使用者进行配准应用。
同时Elastix是开源的,并且采用模块式构成。可以根据源代码进行开发,或者添加新的模块。使用Elastix的源码需要遵循一些开源的规则,如果有使用需求,可以进行了解。

通过Elastix官方网站可以下载到Elastix的程序、源码、使用手册以及一些相关的文献。并且网站上还说明了当使用Elastix时,已经认为引用了一些参考文献。

Elastix的使用

Elastix使用起来非常方便。在Elastix下载可以下载到Elastix的资源。其中Manual是使用手册(推荐阅读)、Example_of_usage

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