解析drugbank xml文件的代码。（先要把文件里的换行符删干净了）

最新推荐文章于 2025-06-24 20:01:08 发布

chealia

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本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/chealia/article/details/87934978

本文档介绍如何处理和解析DrugBank的XML文件，强调在解析前需要删除文件内的换行符，以确保顺利进行代码解析。通过示例代码，详细解释了处理过程和关键步骤。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Created on Wed Dec  5 16:43:28 2018

@author: chealia
"""

import xlrd
from  xlutils.copy import copy
from xml.parsers.expat import ParserCreate

rb=xlrd.open_workbook(r'c:\users\chealia\201812\drug.xlsx')
wb=copy(rb)
global i
i=0
global j
j=0
global flag
flag=0
c1=wb.get_sheet(0)

class DefaultSaxHandler(object):
    def start_element(self,name,attrs):
        global i  #全局变量在使用前还要再声明一次，切记！
        global flag
        global j
        if i>65535:
            return
        if name=='drug' and flag==0:
            c1.write(i,0,attrs.get('type'))
            flag=0
            j=i #第j行就是第i行
            i=i+1 
            
        if name=='drugbank-id' and flag==0:            
            flag=1
        if name=='name' and flag==10:
            flag=2
        if name=='description' and flag==0:            
            flag=3
        if name=='groups' and flag==0:
            flag=4
        if name=='group' and