生信了

本文介绍了生信代码中用到的一些位操作。我们知道，0和1构成的二进制充斥着计算机语言的世界。一般来说，我们对二进制可以操作的最小单位就是一个bit（位）了，一个bit要么是0，要么是1。在编写代码的过程中，如果我们能了解一点位操作，有时可以简化代码、提高效率。这一点对于生信的编程同样适用。应用一：列举k-mer比如，在《算法（三）列举所有k-mer的组合》一文中，笔者曾经分享过一段代码，...

原创: hxj7fscanf 函数用于格式化读入文件中数据，可以大大提高读取文件的效率。这次笔者将最近使用该函数的一些经验记录下来。第一部分：问题和结论fscanf 函数的原型是：int fscanf(FILE* stream, const char* format, [argument...]);fscanf 函数与 scanf 函数用法类似，只不过前者用于读取文件流的数据而已。...

原创: hxj7本文粗浅比较了C语言中常用的几种读取文件的函数的效率，并给出了几段求取某列平均值的代码。第一部分：比较读取文件的效率在之前的文章《生信（五）awk求取某一列的平均值》中，笔者曾经给出过C语言求取某列平均值的代码，但是最近回顾时发现，这段代码至少有几点不足：利用 fgetc 函数来读取文件，现在看来效率不高。如果文件最后没有一个空白行的话，会陷入无限循环。也就是对 E...