文献解读-Chromosome-Scale Genome of Masked Palm Civet (Paguma larvata) Shows Genomic Signatures of Its B

关键词:果子狸;基因组特征;变异检测;


文献介绍

  • 标题(英文):Chromosome-Scale Genome of Masked Palm Civet (Paguma larvata) Shows Genomic Signatures of Its Biological Characteristics and Evolution
  • 标题(中文):果子狸(Paguma larvata)的染色体规模基因组显示其生物学特征和进化的基因组特征
  • 发表期刊:Frontiers in Genetics
  • 作者单位:华大基因农业基因组学国家重点实验室、中国科学院大学生命科学学院等
  • 发表年份:2022
  • 文章地址:https://doi.org/10.3389/fgene.2021.819493

图1  文献介绍

图1 文献介绍

花面果子狸(Paguma larvata)作为一种独特的小型食肉动物,其杂食性饮食习性和作为多种病原体载体的特征引起了广泛的关注。特别是自2003年SARS疫情暴发以来,该物种作为SARS相关冠状病毒的潜在宿主,其重要性更加凸显。尽管目前该物种并未濒危,但其种群数量的持续下降趋势值得关注。

为深入理解花面果子狸的生物学特征,研究采用先进的单管长片段读取(stLFR)和Hi-C技术对其基因组进行测序和组装。研究团队选取一只雄性个体进行基因组组装,采集其16个组织进行RNA测序,并对45个个体(18雄27雌)进行全基因组重测序,以获取全面的基因组信息。

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