79、细胞周期调控基因识别与蛋白质序列 - 结构模式发现

细胞周期调控基因识别与蛋白质序列 - 结构模式发现

在生物学研究中，准确识别细胞周期调控基因以及设计有效的蛋白质序列 - 结构模式（SSPs）对于理解生物过程和功能至关重要。下面将详细介绍相关的方法、数据和实验结果。

细胞周期调控基因识别

1. P 值合并方法

为了识别细胞周期调控基因，研究中使用了多种 P 值合并方法，包括 Logit 方法、Stouffer’s Z - 变换方法和 Liptak - Stouffer 的加权 Z 方法。
- Logit 方法 ：Logit 过程由公式(( )( )\sum_{i = 1}^{N}\frac{P_i}{1 - P_i}=L)给出。在原假设下，L 具有 N 个逻辑随机变量卷积的分布，其分布可近似为(\frac{5N + 4}{3\pi}\left(\frac{5N + 2}{5N + 4}\right)t_{5N + 4}\sim L)。与 L 相关的 P 值可通过(P\left(X>\frac{L}{\frac{3\pi(5N + 4)}{5N + 2}}\right))获得，其中 X 是自由度为 5N + 4 的学生 t 随机变量。
- Stouffer’s Z - 变换方法 ：Z 变换(Z_i=\varPhi^{-1}(P_i))将 N 个独立测试的每个 P 值(P_i)转换为标准正态偏差(Z_i)。如果共同原假设为真，(Z_i)的总和除以测试次数的平方根(\sqrt{N})具有标准正态分布，即(Z_s=\frac{\sum_{i = 1}^{N}Z_i}{\sqrt{N}})可与标准正态分布进行比较，以提供对共同原假设累