python：PyMOL 能处理 *.pdb 文件吗？

PyMOL 完全可以打开并处理 PDB（Protein Data Bank）文件，这是 PyMOL 最主要的功能之一。PDB 格式是结构生物学领域的标准文件格式，专门用于存储生物大分子（如蛋白质、核酸）的三维结构数据。

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在 PyMOL 中打开 PDB 文件的 3 种方法

1. 图形界面操作（推荐初学者）

• File → Open…
• 选择本地 .pdb 文件
• 文件将作为新对象加载到 PyMOL 中

2. 命令行操作（高效直接）

load /路径/文件名.pdb
# 示例：
#load C:/Users/Desktop/1abc.pdb
load r"D:\Python311\Lib\site-packages\pymol\pymol_path\test\dat\1tii.pdb"

3. 直接从 PDB 数据库在线加载