计算机模拟生物/化学反应有哪些软件？

以下是用于计算机模拟生物/化学反应的软件分类总结，涵盖量子化学、分子动力学、化学信息学及新兴混合方法等方向，结合其核心功能和应用场景进行整理：

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⚛️ 一、量子化学计算软件

1. ChemiQ（本源量子）

   • 类型：量子计算化学软件
   • 功能：利用量子算法模拟分子能量、化学反应路径、势能曲线，支持分子动力学轨迹模拟。
   • 优势：针对强关联体系和大分子计算，解决经典计算机算力瓶颈问题，适用于药物设计和新材料开发。
   • 平台：Windows/Linux/Mac，适配量子虚拟机或真实量子芯片。

2. TeraChem

   • 类型：GPU加速量子化学软件
   • 功能：支持密度泛函理论（DFT）、波函数计算、分子动力学模拟，优化化学反应机理研究。
   • 优势：专为GPU设计，计算速度远超传统CPU，适用于500原子以内的中等体系。
   • 平台：Linux（需NVIDIA GPU）。

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⚙️ 二、经典分子动力学（MD）软件

1. Amber

   • 适用体系：蛋白质、核酸等生物大分子。
   • 特点：支持多种力场（GAFF、CHARMM转换）和自由能计算方法（热力学积分