运行interproscan/iprscan会遇到的问题

本文详细探讨了在使用InterProScan进行序列分析时遇到软链接问题的解决方案,通过实验验证了软链接对InterProScan运行的影响,并提供了解决策略。

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1. 运行iprscan的时候,一般需要根据机器的能力和安装interproscan时设置的chunk大小,将序列文件切成若干小文件,这些小文件,每个文件包含1-2个chunk大小序列条数的文件。

这个时候,有可能原始文件也放在切后的文件夹中忘记删除。

 

2.我现在挺怀疑interproscan在书写过程总,对软连接的容错能力的。因为我在两台大型机中都有软连接的存在,在这两台机器上运行都会莫名其妙地报错。而现在在新的大型机上,没有软连接存在,现在依然能够正确运行。有兴趣的可以实验一下。

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