somebody oneday

当初学 Python 时，想要弄懂 Python 的错误信息的含义可能有点复杂。这里列出了常见的的一些让你程序 crash 的运行时错误。1）忘记在 if , elif , else , for , while , class ,def 声明末尾添加 ：（导致 “SyntaxError ：invalid syntax”）该错误将发生在类似如下代码中：?

之前用featureCount 处理得到结果，要提出第一列gene_id 和 readcount 列，首先软件输出的第一行默认是你使用的命令行，没有用，用bash批量删掉。for i in `ls`;do sed -i '1d' $i;done删除当前文件夹下所有文件第一行。其实提出两列很简单，不过我受够了每次一个文件执行一次的烦。想搞成别的程序调用时命令行参数直接就行。第一次知道sy

尝试 count-based 算表达量过后，因为在map这一步一直是把过滤过后的paired 和unpaired reads 一起做的，后面count的时候就要出问题。发现可以用 samtools 从 bam 里分出来，于是就分开count，最后把reads 数相加。在用DESeq什么的。首先，记下 samtools 命令samtools view -bf -1 all.bam > pa

in 文件每行有三列，tab分隔，统计最后一列每个字符出现的字数，其实是数字，但是当作字符处理。没什么问题，主要是最后想要对dict 按key值排序出了问题，python3 的dict不能用sort 什么的，最后也只能搞成按字符排序，而不是按key的数值排序。摘抄一段python 文档>>> # regular unsorted dictionary>>> d = {'banana'