口腔生物医学数据整合解决方案:Oralome与OralCard
1. 引言
在口腔生物医学研究领域,对唾液样本的分析对于揭示人类口腔生物学奥秘、建立蛋白质生物标志物以用于唾液诊断过程具有重要意义。OralCard作为一种重要资源,有望基于对健康和疾病状态下唾液样本的分析,为唾液诊断提供支持。同时,生物医学数据整合面临着诸多挑战,如生命科学资源的异质性和正交性等问题。本文将详细介绍一种针对口腔生物医学数据整合的解决方案,包括Oralome和OralCard的开发、功能及应用。
2. 生物医学数据整合方案概述
生物医学数据整合方案主要基于两个主要组件:Oralome和OralCard。
- Oralome作为后端管道,包含四个功能阶段:数据整理、建模、信息提取和发布。
- OralCard作为前端门户,有两个迭代步骤:建立先前创建的数据库与企业层之间的关系,以及使用Web应用框架为实体设计视图。
3. 具体实施步骤
3.1 唾液蛋白质组的编译与整理
在特定领域,如口腔,手动数据整理是关键步骤,它能确保系统聚焦并为后续迭代建立共同平台。主要活动包括:
- 文献综述 :分析当前最先进的研究成果,确定最终系统的独特性。
- 目标识别 :探索相关文献和数据库,筛选出最终系统应包含的数据和特征。
- 需求分析 :初步了解与所需特征和集成数据相关的技术要求。
此外,由于当时没有将主要和次要唾液腺蛋白质组结合的数据库,需要从不同来源收集信息。主要