3D Slicer - 医学图像检测标注教程(矩形框)

最新推荐文章于 2024-11-18 11:20:37 发布

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分类专栏：可视化目标检测

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/anhec/article/details/105270822

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本文详细介绍了如何使用3D Slicer的Segment Editor模块对DICOM格式的CT数据进行矩形框标注。从安装、数据读取、标注工具使用到保存和删除标注数据，每个步骤都有清晰的说明，特别适合医学图像检测标注。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

对医学3D图像中的病灶区域进行Detection时，需要提供Bounding Box标签。3D Slicer(4.10.2)中的Segment Editor与Legacy/Editor都可以对三维体数据中的ROI进行矩形标签框注。Segment Editor较为方便，虽然这个模块本身是用于像素级Segmentation的标注，但是也可以用来标注ROI的矩形框。本文介绍如何使用3D Slicer的Segment Editor模块对DICOM格式的CT数据进行矩形框标注；标注过程中，每个流程都可能会出现问题，建议先随意地标记几张slice，然后导出保存。当整个流程没有出现问题时，再开始正式地标记。

一、安装软件

现在最新的3D slicer是4.10.2版本的，官网可以免费下载。https://download.slicer.org/，下载完成后点击安装包傻瓜式安装 (安装路径不能有中文)。
另外，如果电脑用户名user是中文的话，有可能会出现问题，例如最后导出的文件夹为空，解决方法：在3D slicer的导航栏里的Edit – Application settings里，修改Module – Temporary directory为全英文路径：
在这里插入图片描述

二、读取数据

打开3D slicer后，首先导入3D数据(DICOM格式)。

将包含.dcm文件序列的文件夹直接拖入3D Slicer，导入文件路径不能有中文，选择reader:

注意：一个病人有多个扫描的CT，选择薄层的，就是上图的S0004文件夹。
导入完成后，点击弹窗的OK：

然后会弹出DICOM Brower：

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