MPI-IO:Open/close/delete

本文介绍了MPI中的文件操作,包括文件的打开、关闭及删除等基本功能。文件打开时需指定一致的文件名和打开模式,但各进程可以传递不同的运行时信息。提供了多种文件打开模式以适应不同场景需求。
MPI_FILE_OPEN(comm, filename, amode, info, fh)
IN   comm    组内通信域
IN   filename  将打开的文件名
IN   amode    打开方式
IN   info    传递给运行时的信息
OUT   fh     返回的文件句柄
int MPI_File_open(MPI_Comm comm, char * filename, int amode, MPI_Info info, 
      MPI_File * fh)
MPI_FILE_OPEN(COMM,FILENAME, AMODE, INFO, FH,IERROR)
 CHARACTER *(*) FILENAME
 INTEGER COMM, AMODE, INFO, FH, IERROR
  MPI_FILE_OPEN是一个组调用,即通信域comm中的所有进程都必须按给定的文件名filename来执行它,各进程使用的文件名filename要相同,给定的打开方式amode也要相同,但是各进程传递给运行时的信息info可以互不相同。该调用返回一个文件句柄fh,以后各进程对文件的具体操作都是通过文件句柄fh来实现的。
  根据用途的不同,打开方式可以是如下所示的任何9种方式之一。
文件打开方式 

打开方式	含义
MPI_MODE_RDONLY	只读
MPI_MODE_RDWR	读写
MPI_MODE_WRONLY	只写
MPI_MODE_CREATE	若文件不存在则创建
MPI_MODE_EXCL	创建不存在的新文件,若存在则错
MPI_MODE_DELETE_ON_CLOSE	关闭时删除
MPI_MODE_UNIQUE_OPEN	不能并发打开
MPI_MODE_SEQUENTIAL	文件只能顺序存取
MPI_MODE_APPEND	追加方式打开,初始文件指针指向文件尾


MPI_FILE_CLOSE(fh)
INOUT   fh    前面打开的文件句柄
int MPI_File_close(MPI_File * fh)
MPI_FILE_CLOSE(FH,IERROR)
  INTEGER FH, IERROR

  MPI_FILE_CLOSE关闭前面已经打开的与句柄fh相联系的文件,它也是一个组调用,即所有打开该文件的进程,也必须都执行关闭操作。这里虽然没有明确指出通信域或进程组,但是,文件句柄fh已包含了进程组的信息。

MPI_FILE_DELETE(filename, info)
IN   filename    将删除的文件名
IN   info      传递给运行时的信息
int MPI_File_delete(char * filename, MPI_Info info)
MPI_FILE_DELETE(FILENAME, INFO, IERROR)
  CHARACTER *(*) FILENAME
  INTEGER INFO, IERROR

MPI_FILE_DELETE删除指定的文件filename。



http://comic.sjtu.edu.cn/thucs/GD_jsj_014b/content/chapter17/section1/part01/index1.htm

<think> 我们之前已经讨论过类似的问题,现在用户遇到了使用mpiicx编译时报告“unknown target CPU 'generic'”的错误。用户提供了具体的icx版本(2025.0.4)和编译命令。根据历史记录和分析,这个错误通常是由于编译器标志冲突引起的。 关键点: - 用户使用的是Intel MPI编译器包装器mpiicx,它调用的是Intel的icx编译器。 - 错误信息指出“unknown target CPU 'generic'”,而generic并不是icx编译器支持的CPU类型(从错误信息中列出的长长列表可见)。 - 在之前的回答中,我们提到这个错误通常是因为环境变量(如CFLAGS)中包含了不兼容的编译器标志,比如GCC的`-march=generic`,而icx并不支持这个标志。 解决方案步骤: 1. **检查环境变量**:首先,检查是否设置了CFLAGS、CXXFLAGS等环境变量,这些变量可能包含了`-march=generic`。使用以下命令: ```bash echo $CFLAGS echo $CXXFLAGS ``` 如果发现其中有`-march=generic`,则清除它: ```bash unset CFLAGS unset CXXFLAGS ``` 2. **显式指定目标架构**:如果用户确实需要指定目标CPU架构,应该使用icx支持的选项。例如,使用`-xHost`可以让编译器为当前运行编译的CPU生成最优代码(该选项会检测当前机器的CPU并优化)。或者,从错误信息列出的支持CPU中选择一个,比如`-march=sandybridge`等。 3. **修改编译命令**:用户当前的编译命令是: ```bash mpiicx -O3 -xHost mpi_test.c -o mpi_test ``` 如果环境变量中没有冲突的标志,那么可能是mpiicx在调用icx时传递了某些默认参数导致了问题。我们可以尝试简化命令,去掉`-xHost`看是否可行: ```bash mpiicx -O3 mpi_test.c -o mpi_test ``` 如果这样能编译通过,则说明问题出在`-xHost`上。但根据Intel文档,`-xHost`是icx支持的一个合法选项。因此,我们需要进一步检查。 4. **检查icx的版本和兼容性**:用户使用的icx版本为2025.0.4,这是一个较新的版本。我们需要确认该版本是否仍然支持`-xHost`选项。实际上,`-xHost`是Intel编译器的传统优化选项,通常用于指定为当前主机CPU优化。如果该选项被移除,那么应该使用`-march=native`(注意,Intel编译器可能并不支持`-march=native`,因为这是GCC的选项)。根据Intel编译器文档,icx在2021年以后开始支持LLVM的某些选项,但`-xHost`仍然有效。 5. **直接调用icx测试**:为了排除mpiicx包装器的问题,我们可以直接用icx编译: ```bash icx -O3 -xHost mpi_test.c -o mpi_test ``` 如果这个命令也报同样的错误,那么问题出在icx上。需要检查icx的安装是否正确。 6. **查看icx支持的选项**:我们可以通过查看帮助信息来确认: ```bash icx --help ``` 或者查看特定选项: ```bash icx -### -O3 -xHost mpi_test.c 2>&1 | grep generic ``` 这可能帮助我们找到传递了`generic`参数的地方。 7. **更新编译器**:如果确认是编译器的问题,考虑更新到最新版本或已知稳定的版本。 8. **使用兼容性更好的选项**:如果问题依然存在,可以尝试使用其他优化选项,比如`-O3`不带`-xHost`,或者使用`-march=core-avx2`(根据当前CPU选择)等。 9. **检查MPI库的兼容性**:用户提供的编译命令中,mpiicx链接了Intel MPI库。这些库可能是用GCC编译的,而icx与GCC编译的库可能存在ABI兼容性问题。但通常,Intel MPI会提供与Intel编译器兼容的库。不过,如果系统同时存在多个MPI实现(如OpenMPI),可能会冲突。因此,确保环境变量正确指向Intel MPI。 10. **确认MPI环境加载**:运行`which mpiicx`确保使用的是Intel MPI版本的mpiicx,并且已经通过`setvars.sh`脚本设置好环境: ```bash source /opt/intel/oneapi/setvars.sh ``` 11. **查看详细的编译命令**:使用`-v`选项来查看mpiicx调用的详细命令,找出哪里传递了`-march=generic`: ```bash mpiicx -v -O3 -xHost mpi_test.c -o mpi_test ``` 在输出中,我们会看到mpiicx最终调用icx的命令行,从中可以检查是否有`-march=generic`被加入。 综上所述,最可能的原因是环境变量中设置了冲突的编译标志(如CFLAGS)。请用户先检查并清除这些环境变量。 如果问题仍未解决,请尝试以下命令(显式指定一个具体的CPU架构): ```bash mpiicx -O3 -march=sandybridge mpi_test.c -o mpi_test ``` 注意:将`sandybridge`替换为实际CPU架构(比如用户机器是Haswell架构,则用`haswell`)。 如果用户不知道当前CPU架构,可以运行: ```bash lscpu | grep "Model name" ``` 然后对照Intel编译器支持的CPU架构列表(错误信息中列出的)进行选择。 生成的相关问题: 1. 如何检查当前Linux系统的CPU架构? 2. Intel编译器(icx)支持哪些优化选项? 3. 如何正确设置Intel oneAPI的环境变量? 4. 如何解决Intel MPIOpenMPI之间的冲突? 5. 为什么使用`-xHost`选项可能会导致编译错误? 6. 如何查看mpiicx包装器最终调用的编译器命令? </think> ### 解决 `mpiicx` 编译错误:`unknown target CPU 'generic'` 根据您的环境(icx 2025.0.4, Intel MPI 2021.14),此错误通常由 **编译器标志冲突** 或 **环境配置问题** 导致。以下是完整解决方案: --- #### 1. **清除冲突环境变量**(首要步骤) 检查并清除可能覆盖编译选项的环境变量: ```bash unset CFLAGS CXXFLAGS FCFLAGS # 关键!清除冲突标志 echo $CFLAGS # 验证是否为空 ``` #### 2. **修复编译器调用命令** 直接使用完整路径调用 `mpiicx`,避免包装器干扰: ```bash /opt/intel/oneapi/mpi/2021.14/bin/mpiicx \ -O3 -xHost \ -I/opt/intel/oneapi/mpi/2021.14/include \ mpi_test.c -o mpi_test ``` **关键修改**: - 移除 `-L` 和 `-Xlinker` 选项(MPI 包装器会自动处理) - 显式指定 `-xHost` 而非 `-march=generic`(后者是 GCC 标志) #### 3. **验证 icx 编译器兼容性** 单独测试底层编译器是否支持 `-xHost`: ```bash icx -O3 -xHost -c dummy.c # 应成功编译 ``` 若失败,说明编译器安装异常: ```bash source /opt/intel/oneapi/setvars.sh # 重载环境 which icx # 检查路径:应为 /opt/intel/oneapi/compiler/latest/bin/icx ``` #### 4. **检查系统库兼容性** 某些系统库(如 GLIBCXX)可能与 Intel 工具链冲突: ```bash ldd /opt/intel/oneapi/mpi/2021.14/lib/libmpi.so | grep stdc++ ``` 若输出包含非 Intel 路径(如 `/usr/lib/x86_64-linux-gnu`),需修复路径优先级: ```bash export LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/oneapi/compiler/latest/lib:$LD_LIBRARY_PATH ``` #### 5. **备选方案:显式指定 CPU 架构** 如果 `-xHost` 仍失败,从错误信息中选择当前 CPU 架构: ```bash # 查看 CPU 型号(示例为 Tiger Lake) cat /proc/cpuinfo | grep "model name" | uniq # 使用对应架构编译 /opt/intel/oneapi/mpi/2021.14/bin/mpiicx \ -O3 -march=tigerlake \ mpi_test.c -o mpi_test ``` --- ### 错误原因分析 1. **标志冲突** `-march=generic` 是 GCC 特有标志,Intel 编译器(icx)不支持[^1]。这通常由环境变量(如 `CFLAGS`)或构建系统隐式添加。 2. **MPI 包装器污染** `mpiicx` 在传递参数时可能受系统其他 MPI 安装干扰(如 OpenMPI),显式使用完整路径可规避[^2]。 3. **ABI 不匹配** Intel MPI 库依赖特定 GLIBCXX 版本,与 Conda/系统库冲突时引发加载错误[^1]。 --- ### 验证成功编译 运行测试程序: ```bash mpirun -np 4 ./mpi_test ``` 若提示 `libmpi.so` 缺失,添加临时库路径: ```bash export LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/oneapi/mpi/2021.14/lib:$LD_LIBRARY_PATH ``` --- ### 相关问题 1. 如何永久设置 Intel oneAPI 的环境变量? 2. 混合使用 Intel 编译器与 GCC 时如何避免标志冲突? 3. `-xHost` 和 `-march=native` 在性能优化中有何区别? 4. 如何检测系统中已安装的 MPI 实现及其优先级? 5. 为什么 GLIBCXX 版本不匹配会导致 MPI 库加载失败?[^1] [^1]: 系统库与 Intel 工具链的兼容性问题 [^2]: MPI 多版本共存时的路径管理原则
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